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草原樱桃PGIP基因的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 于文全 1 ; 刘海荣 1 ; 杨晓华 1 ; 赵恒田 2 ;

作者机构： 1.黑龙江省农业科学院牡丹江分院

2.中国科学院东北地理与农业生态研究所

关键词： 草原樱桃;PGIP基因;基因克隆;生物信息学

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2012 年 27 卷 06 期

页码： 38-42

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了克隆草原樱桃多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因,并进行生物信息学分析。以草原樱桃叶片基因组为模板,PGIP基因保守序列设计引物,通过PCR扩增获得约1 kb的DNA片段。序列分析表明,该基因全长1 193 bp,包含有1个完整的开放阅读框,由2个外显子和1个内含子构成,外显子总长990 bp,编码330个氨基酸,其编码的氨基酸序列中含有一段典型的亮氨酸重复序列,GenBank登录号为GU068977;该基因与中国李、杏、桃、马哈利樱桃、梅等李属植物的PGIP基因序列一致度达95%～99%。系统进化分析显示,属内亲缘关系较近、属间亲缘关系较远的特点。克隆了草原樱桃PGIP基因,为樱桃抗病育种提供一条新的基因资源。

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