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筛选金线莲种质资源的通用DNA条形码序列及鉴定其混伪品

文献类型： 中文期刊

作者： 梅瑜 1 ; 邱道寿 2 ; 肖深根 1 ; 彭淼 1 ; 陈栋 1 ;

作者机构： 1.湖南农业大学园艺园林学院

2.广东省农业科学院作物研究所

关键词： 金线莲(Anoectochilus roxburhii);DNA条形码;分子鉴定;ITS

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2019 年 015 期

页码： 5163-5170

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究对32份金线莲(Anectochilus roxburhii)种质资源的四个DNA条形码(ITS, rbcL, psbA-trnH,matK)基因进行PCR扩增及测序,从基因库下载了金线莲及其3种主要混伪品的29条序列,分析比较各序列的差异位点、信息位点、GC含量等,并进行种内和种间的遗传距离计算,构建基于K2P模型的NJ系统发育树,综合比较不同序列的鉴定能力,最终从四个DNA条形码候选序列中筛选出可用于金线莲资源鉴定的通用序列.结果显示,ITS和psbA-trnH基因序列的种内、种间的变异位点差异和遗传距离差异较大,相比rbcL和matK序列具有显著优势,且ITS基因不仅能够快速而准确区分金线莲及其混伪品,而且能够在种内水平上区分金线莲的不同品种.因此,ITS基因序列是较适合鉴别金线莲资源的理想条形码.所得结论与前人关于金线莲的有效成分的研究结果进行了关联,发现不同品系的金线莲所含有效成分差异较大.因此,本研究可以为金线莲的功能产品研发、优良品种选育、药理药效研究等方面提供帮助,尤其在金线莲资源选择上提供了较为理想的方法,研究具有一定的应用前景和科学价值.

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