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谷子B3转录因子可变剪切体分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘辉 1 ; 王晓蒙 1 ; 闫留延 1 ; 王永芳 2 ; 杨朋娟 1 ; 龚珂珂 1 ; 李兴杰 1 ; 董志平 2 ; 贾小平 1 ;

作者机构: 1.河南科技大学农学院

2.河北省农林科学院谷子研究所

关键词: 谷子;B3转录因子;可变剪切;抽穗期;地理环境

期刊名称: 浙江农业学报

ISSN: 1004-1524

年卷期: 2024 年 36 卷 009 期

页码: 1969-1976

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 通过分析不同谷子品种B3转录因子基因存在的可变剪切类型,鉴定出具有功能活性的可变剪切体,并分析这些可变剪切体与谷子抽穗期是否具有相关性,为深入揭示B3转录因子可变剪切对谷子生长发育的调控作用提供依据。选择12份不同抽穗期的谷子材料,利用反转录PCR(reverse transcription PCR, RT-PCR)技术克隆了一个REM家族的B3转录因子基因,通过序列比对鉴定该基因存在的可变剪切体类型,分析这些可变剪切体的活性及其与抽穗期的关系。结果表明,B3转录因子基因在这12个谷子品种间共产生了8种可变剪切体,其中可变剪切体Ⅴ包含的品种最多(4个),其次为可变剪切体Ⅳ(2个),其余6种可变剪切体均只包含1个品种。通过可变剪切,12个品种的B3转录因子基因共可编码10种蛋白质,其中5种蛋白质缺失B3 DNA结合域;Ⅱ型蛋白质具有缩短谷子抽穗期的功能,Ⅵ型蛋白质具有延长谷子抽穗期的功能,且这种作用不受地理环境影响。以上结果表明,B3转录因子通过可变剪切参与谷子抽穗期的调控。

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