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两种电泳方法在分析新陆早系列品种SSR标记结果中的比较与应用

文献类型： 中文期刊

作者： 叶春秀 1 ; 李有忠 2 ; 庄振刚 2 ; 谢宗铭 2 ;

作者机构： 1.新疆农垦科学院分子农业技术育种中心

2.新疆农垦科学院分子农业技术育种中心,作物种质创新与基因资源利用兵团重点实验室

关键词： SSR;两种电泳方法;比较;分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2014 年 05 期

页码： 75-79

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究两种电泳方法在新陆早系列材料SSR分析不同阶段使用效果的可行性,本研究利用2.5%琼脂糖凝胶和6%聚丙烯酰胺凝胶对新陆早系列材料SSR扩增结果进行检测。结果显示,两种电泳方式都能够得到较为清晰的扩增条带,但在获得的条带总数及多态性比率上有所差异。琼脂糖凝胶电泳共检测出30条条带,其中有18条为多态性条带,多态性比率为60%;而在聚丙烯酰胺电泳方法共检测出50条条带,多态性条带为33条,多态性比率为66%。基于两种电泳方法所获得的SSR标记位点,利用SPSS和PopGen32软件计算遗传相似系数,并构建遗传关系聚类图。分析结果显示,两种电泳方法所获得的聚类结果大致相同,在个别品种的分析结果上存在着一定程度上的差异。其中,聚丙烯酰胺凝胶获得的分析结果与实际遗传背景拟合性较好,所以,在最终的SSR标记分析过程中采用6%的聚丙烯酰胺凝胶进行分析效果更好,而琼脂糖凝胶电泳更加适合早期SSR标记引物的大量筛选。为新陆早系列材料SSR标记快速、准确分析提供了研究方法与技术支持。

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