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烟草NtMYB102转录因子基因克隆及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 平文丽 1 ; 孙计平 1 ; 郭梅燕 2 ; 孙焕 1 ; 张雪珂 1 ; 李雪君 1 ;

作者机构: 1.河南省农业科学院烟草研究所

2.项城市农业科学研究所

关键词: 烟草;蚜虫;转录因子;生物信息学;NtMYB102

期刊名称: 烟草科技

ISSN: 1002-0861

年卷期: 2023 年 56 卷 011 期

页码: 16-23

收录情况: 北大核心

摘要: 为解析NtMYB102转录因子的结构并预测其功能,采用同源克隆和Sanger测序法,从烟草品种K326中获得NtMYB102基因的CDS序列,基于该序列分析NtMYB102基因编码蛋白的理化性质、结构域和基因上游顺式作用元件.从NCBI SRA数据库中下载烟草接种青枯雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)后的转录组原始数据,分析NtMYB102基因的表达量变化,并采用实时荧光定量PCR法分析烟草接种蚜虫后NtMYB102基因的相对表达量变化.结果表明:①NtMYB102基因全长1 131 bp,编码的NtMYB102蛋白由376个氨基酸组成,具有典型的MYB特征结构域,是一个无信号肽、无跨膜结构、具有磷酸化位点的亲水蛋白.②NtMYB102基因上游2 000 bp有多个与逆境胁迫、病原响应相关的调控元件.③抗烟草青枯病品种岩烟97接种青枯雷尔氏菌后36 h,NtMYB102基因表达量显著低于0h,表明该基因可能在烟草响应青枯雷尔氏菌的侵染中起调控作用.④接种蚜虫后,烟草品种中烟100 NtMYB102基因的相对表达量显著提高,表明该基因可能参与烟草对蚜虫取食的响应.

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