文献类型： 中文期刊
作者： 吴小嫒 1 ; 姜山 1 ; 陈波 2 ; 闫慧清 1 ;
作者机构： 1.贵州师范大学 生命科学学院
2.贵州省土壤肥料研究所
关键词： 小立碗藓;U-box家族;基因表达;功能分析;全基因组鉴定
期刊名称： 广西植物
ISSN： 1000-3142
年卷期： 2024 年 44 卷 009 期
页码： 1678-1688
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： U-box家族编码E3 泛素连接酶能够特异性识别底物,从而调控蛋白的修饰和降解过程.为鉴定小立碗藓U-box家族成员,分析其生物学特征及基因表达规律,该研究基于小立碗藓的全基因组测序数据,通过生物信息学技术对泛素连接酶U-box家族成员的理化性质、进化关系、顺式作用元件、组织表达模式、胁迫响应等进行了分析.结果表明:(1)在小立碗藓全基因组中共鉴定得到 31 个U-box家族成员,并且不均匀地分布于 14 条染色体上;其分子量大小在 37.75~117.49 kDa之间,等电点介于 5.32~8.55 之间.(2)进化树显示,小立碗藓的U-box家族成员分布在Ⅰ-Ⅸ亚家族中,其中亚家族Ⅶ含有小立碗藓成员最多,共 11个(约占 36.67%),说明小立碗藓在历史进化过程中具有高度保守性且功能多样化.(3)经启动子分析发现,小立碗藓U-box家族成员具有结合GA和ABA等多个激素的元件.(4)组织表达分析发现小立碗藓U-box家族成员主要在绿丝体、轴丝体和孢子体S3 时期大量表达.(5)通过ABA、甘露醇和饱和LiCl处理后发现,配子体的拟茎均发生黄化且PpPUB21 的表达量均被显著诱导.推测小立碗藓U-box家族成员在生长发育和响应逆境胁迫中发挥着重要作用,这为后续深入研究小立碗藓U-box家族成员的基因功能研究奠定了理论基础,也为其相关研究提供了参考.
- 相关文献
[1]水稻核糖体失活蛋白家族基因OsRIP8的生物信息学与功能分析. 徐娅,黄佑岗,李树杏. 2024
[2]甘蓝型油菜FAF基因家族鉴定并挖掘分枝形成相关成员. 蒋先润,罗桂林,梁峰豪,黄莎,肖华贵,张超,代文东. 2022
[3]芥菜Trihelix转录因子家族全基因组鉴定分析. 李魁印,段丽丽,胡云,李伟,付文苑,杨巍,唐兵,常向彩. 2025
[4]谢瓦氏曲霉间型变种esdC基因的功能分析. 刘荣,谭玉梅,刘永翔,刘作易. 2015
[5]日粮类型对猪肌肉组织HSL mRNA和Obese mRNA基因表达的影响. 王安娜,邓蓉,张定红,张洁. 2012
[6]湖北海棠5A基因进化与表达分析. 罗昌国,乔玉山,张计育,薛华柏,高志红,渠慎春,章镇. 2011
[7]茯砖茶“金花菌”vcx基因克隆及表达分析. 任秀秀,谭玉梅,任春光,王玉臣,刘永翔,刘作易. 2017
[8]冠突散囊菌转录因子stf1基因的克隆及其表达分析. 谭玉梅,王玉臣,刘永翔,桑石磊,刘作易. 2015
[9]捕捞应激对团头鲂不同组织中Nrf2-Keap1信号通路相关基因表达的影响. 赵振新,杨明举,张显波,赵凤,杨星,赵飞,刘伟. 2020
[10]冠突曲霉钙调素cam基因的克隆及表达分析. 任秀秀,余芳,谭玉梅,任春光,刘永翔,王玉臣,刘作易. 2017
[11]火龙果开花调控转录因子基因HpSOC1的克隆与表达分析. 严佳文,解璞,袁启凤,肖图舰,毛永亚,马玉华. 2018
[12]青海湖裸鲤klf2基因的克隆与功能初步分析. 闵倩雯,周其椿,熊伟,张显波,李建光,曾圣,陈飞雄,杨兴. 2021
[13]青海湖裸鲤eif5b基因克隆与初步功能分析. 周其椿,张显波,李建光,曾圣,闵倩雯,陈飞雄,杨兴. 2021
[14]盐胁迫下胡萝卜肉质根中木质素响应机理研究. 陈皓炜,陈梦娇,王雅慧,张榕蓉,王欣蕊,徐志胜,谭国飞,熊爱生. 2021
[15]雷帕霉素对稀有鮈鲫卵子发生的影响. 钱佳铭,张显波,董然然,曾圣,李建光,陈飞雄. 2021
[16]青海湖裸鲤foxk1基因克隆和初步功能分析. 闵倩雯,张显波,周其椿,李建光,曾圣,陈飞雄,杨兴. 2020
[17]百脉根TALE转录因子家族的鉴定与生物信息学分析. 丘日光,张天缘,杨仕梅,宋莉,赵德刚. 2019
[18]三个耐冻性不同的马铃薯野生种中FAD2基因的克隆及表达分析. 李飞,徐建飞,刘杰,段绍光,卞春松,Jiwan P.PALTA,金黎平. 2014
[19]温敏核不育基因在籼型三系遗传背景下的育性表达. 王际凤,陆作楣. 2006
[20]映山红杜鹃MADS基因家族的鉴定与分析. 杨丽,严露露,李慧娥,杜致辉,郑淇元. 2021
作者其他论文 更多>>
-
羊肚菌新品种‘乐丰2号’
作者：张钦语;朱森林;王晓敏;陈波;陈旭;杜慕云;杨珍;唐玲;张邦喜;杨仁德
关键词：羊肚菌;品种
-
羊肚菌新品种'黔羊肚菌1号'
作者：金琳山;陈波;王晓敏;朱森林;张邦喜;张钦语;杨仁德
关键词：羊肚菌;品种
-
羊肚菌种植区土壤重金属积累特征及生态风险评价
作者：杨珍;刘慧娟;陈旭;杜慕云;朱森林;陈波;王晓敏;杨仁德;张邦喜;张钦语
关键词：羊肚菌;土壤重金属;地累积综合污染指数法;潜在生态风险指数法;污染负荷指数法
-
羊肚菌产地调查及安全性评价
作者：朱森林;杨珍;张邦喜;陈波;王晓敏;张钦语;杨仁德
关键词：羊肚菌;安全性;评价
-
黔芝2号的栽培配方筛选
作者：张钦语;韦春某;张邦喜;杨仁德;陈旭;陈波;王晓敏;朱森林
关键词：巨菌草;代料栽培;灵芝产量;多糖;三萜类物质;黔芝2号
-
不同施肥模式对鲜食玉米肥料利用率、产量及品质的影响
作者：陈波;魏全全;杨仁德;周瑞荣;苟久兰;张邦喜
关键词：鲜食玉米;施肥措施;产量;养分积累;品质
-
蚯蚓饲料化开发利用进展
作者：孔德顺;陈波
关键词：饲料蛋白源;蚯蚓液;金属螯合物;开发利用;蚯蚓
