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盐地碱蓬SsDREB基因的克隆与表达分析研究

文献类型: 中文期刊

作者: 刘晓雪 1 ; 孙晓波 2 ; 王秀娥 1 ; 马鸿翔 2 ;

作者机构: 1.南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室

2.江苏省农业科学院省农业生物学重点实验室

关键词: 盐地碱蓬;SsDREB;RACE;表达分析

期刊名称: 核农学报

ISSN: 1000-8551

年卷期: 2011 年 25 卷 04 期

页码: 74-81

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 盐地碱蓬(Suaeda salsa L.)是典型的盐碱地指示性植物。本研究以盐地碱蓬为材料,根据其他植物中干旱应答元件结合蛋白保守区的氨基酸序列设计简并引物,通过PCR扩增到一条长180bp的cDNA片段,继而利用RACE技术克隆了一个盐地碱蓬DREB基因全长cDNA,命名为SsDREB。SsDREBcDNA全长为1493bp,5'端有34bp的非翻译区,3'端具有完整的polyA尾,包含一个编码364个氨基酸的完整的开放阅读框。通过NCBI SMART对蛋白的保守区预测表明,其具有一个典型的AP2/EREBP保守结构域。AP2域的同源性比较分析表明,SsDREB与构树BpDREB、陆地棉GhDREB2蛋白具有97%、95%的同源性,进化分析表明SsDREB蛋白和陆地棉的亲缘关系最近。实时定量PCR结果表明,SsDREB基因在盐地碱蓬根、茎、叶中均有表达,且在叶中的表达量最高,在茎中的表达量最低。对碱蓬幼苗进行高盐、干旱、低温及ABA处理,进行表达胁迫分析,表明该基因的表达受高盐和干旱诱导,而对ABA和低温处理反应不明显,表明该基因在盐地碱蓬对干旱、高盐胁迫应答中起重要作用。

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