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利用重组自交系定位水稻种子低氧发芽力QTL

文献类型: 中文期刊

作者: 张所兵 1 ; 张云辉 1 ; 陈海元 1 ; 林静 1 ; 汪迎节 1 ; 朱晓妹 1 ; 宋春凤 2 ; 方先文 1 ;

作者机构: 1.江苏省农业科学院种质资源与生物技术研究所江苏省农业种质资源保护与利用平台

2.江苏省中国科学院植物研究所

关键词: 直播稻;重组自交系;低氧发芽;QTL定位

期刊名称: 华北农学报

ISSN: 1000-7091

年卷期: 2020 年 006 期

页码: 31-35

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 鉴定低氧发芽力强的水稻资源,进而挖掘控制低氧发芽的QTL,可以为改良直播稻低氧发芽能力提供材料基础和基因资源。在装满无菌水的10 cm高的离心管中鉴定了云南省籼稻地方品种扎西玛、江苏省优良食味粳稻品种南粳46及包含135个家系的扎西玛/南粳46 RIL群体的低氧发芽力。以28℃黑暗培养7 d的胚芽鞘长度作为低氧发芽力的评价标准。结果表明:在淹水7 d后,扎西玛和南粳46胚芽鞘长度分别为2.92,6.68 cm,二者在P=0.01水平上存在极显著差异。进而对扎西玛/南粳46 RIL群体135个家系低氧发芽力QTL分析发现,在水稻第12号染色体上的RM1300和RM1227之间检测到一个控制低氧发芽力的QTL(qAG-12)。该QTL的LOD值为3.04,可以解释11.24%的表型变异。生物信息学分析表明,qAG-12位于第12染色体上26.00~27.34 Mb的1.34 Mb范围内。该区域共有200多个注释基因,未见已报道控制低氧发芽力的QTL。以上结果表明:扎西玛和南粳46低氧发芽力存在极显著差异;qAG-12是一个新的控制低氧发芽力的QTL。

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