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彩色马铃薯查尔酮合酶基因的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 聂利珍 1 ; 李晓东 1 ; 谢锐 1 ; 房永雨 1 ;

作者机构： 1.内蒙古自治区农牧业科学院

关键词： 彩色马铃薯;查尔酮合成酶基因;基因克隆;生物信息学分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2022 年 023 期

页码： 7679-7686

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究彩色马铃薯块茎中花色苷积累的分子机制，明确查尔酮合成酶（CHS）在花色苷合成途径中作用，本研究以彩色马铃薯品种‘红美’块茎作为实验材料，根据GenBank数据库中已注册马铃薯CHS基因的cDNA序列设计引物，通过RT-PCR方法克隆了一个CHS基因，命名为StCHS1b。StCHS1b基因cDNA序列共1 223 bp，开放阅读框为1 170 bp，编码389个氨基酸。分子质量约为42.48 kD，理论等电点为6.3。生物信息学分析表明，该蛋白为亲水性的稳定蛋白质，而且含有CHS家族序列标签的保守区域GVLFGFGPGLT，无信号肽，不含有跨膜区。Blastn分析表明，StCHS1b基因序列与其他物种的CHS基因序列均具有较高同源性，编码区氨基酸相似性高达99%。进化分析表明，彩色马铃薯StCHS1b与番茄SlCHS、茄子Sm CHS、辣椒CaCHS、烟草NtCHS和黑果枸杞LrCHS聚在同一个分支，都属于茄科，它们的亲缘关系最近，与苹果MdCHS和覆盆子RiCHS亲缘关系较远。

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