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五种鲟鱼线粒体控制区异质性和系统发育分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王巍 1 ; 朱华 1 ; 胡红霞 1 ; 田照辉 1 ; 董颖 1 ;

作者机构： 1.国家淡水渔业工程技术研究中心暨北京市水产科学研究所

关键词： 线粒体控制区;西伯利亚鲟;史氏鲟;小体鲟;达氏鳇;俄罗斯鲟;重复序列;异质性

期刊名称： 动物学研究

ISSN： 0254-5853

年卷期： 2009 年 30 卷 05 期

页码： 17-26

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用保守引物得到5种鲟鱼的线粒体DNA(mtDNA)控制区(D-loop)全长,长度在795～813bp。序列中包括了CBS(conserved sequence block)和TAS(term ination-associated sequence)区域。利用最大似然法、最大简约法和贝叶斯法构建了系统发育树,发育树分成两枝,呈现明显的生物地理分布。分析表明,现有的鳇属鱼类不是单系群起源。5种鲟鱼D-loop序列都存在长度和数目不等串联重复序列,长度在78～82bp之间,重复序列拷贝数在4～6次不等,因此造成了mtDNA广泛的异质性现象。不同种类的重复序列单元十分相似,达氏鳇和史氏鲟重复序列单元相似度为82.93%,西伯利亚鲟和俄罗斯鲟重复序列单元相似度为90.59%。在串联重复序列后是一段不完全重复序列。通过与已有同种的重复序列比对发现不同鲟鱼重复序列相同,不同地理区域相同物种的重复序列可能发生过分子内重组。这些表明重复序列在鲟鱼进化上具有相关意义,推测重复序列可能产生在种分化前,重组发生在种分化后。

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