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金线莲ArLBD1基因克隆、亚细胞定位及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 林江波 1 ; 黄惠明 1 ; 邹晖 1 ; 李和平 1 ; 戴艺民 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院亚热带农业研究所

关键词： 金线莲;ArLBD1;亚细胞定位;基因克隆;原核表达

期刊名称： 北方园艺

ISSN：

年卷期： 2024 年 001 期

页码： 100-106

收录情况： 北大核心

摘要： 以金线莲（Anoectochilus roxburghii）叶片的转录组数据为基础，采用RT-PCR技术克隆到了金线莲ArLBD1转录因子基因，采用生物信息学、原核表达、Western blot、亚细胞定位及qPCR等方法对该基因功能进行初步分析，以期为进一步研究其功能提供参考依据。结果表明：ArLBD1基因CDS长度864 bp,编码287个氨基酸。ArLBD1蛋白分子量为30.62 kD,理论等电点为6.25,不稳定系数55.55,属于不稳定蛋白。ArLBD1蛋白含有LOB superfamily保守结构域，第7～28氨基酸为C基序，第36～84氨基酸为GAS基序，第89～107氨基酸为类亮氨酸拉链基序，具有完整的类亮氨酸拉链基序，属于ClassⅠ。系统进化分析表明ArLBD1与拟南芥AtLBD36的亲缘关系最近，其次是AtLBD6。SDS-PAGE电泳及Western blot结果显示，ArLBD1基因在大肠杆菌中成功诱导表达。亚细胞定位分析发现ArLBD1蛋白定位在细胞核。qPCR分析结果表明，ArLBD1基因在金线莲叶、茎和根中都能检测到表达，在叶片表达量最高，其次是根，茎的表达量最低，推测ArLBD1基因主要在金线莲叶片发育中发挥功能。

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