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民猪CIRP基因的克隆与冷诱导研究

文献类型： 中文期刊

作者： 张冬杰 1 ; 刘娣 1 ; 汪亮 1 ; 别墅 1 ; 杨国伟 1 ;

作者机构： 1.黑龙江省农业科学院

关键词： 民猪;冷诱导RNA结合蛋白;变异体;冷诱导

期刊名称： 东北农业大学学报

ISSN： 1005-9369

年卷期： 2012 年 12 期

页码： 7-11

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用生物信息学结合RT-PCR的方法,克隆民猪的冷诱导RNA结合蛋白(Cold inducible RNA-binding protein,CIRP)基因,获得3个变异体序列。猪CIRP变异体1基因cDNA长1 278 bp(GenBank登录号:HQ908794),编码172个氨基酸;变异体2基因cDNA长1 653 bp(GenBank登录号:HQ908795),编码182个氨基酸;变异体3基因cDNA长1 765 bp(Genbank登录号:HQ908796),编码144个氨基酸。CIRP变异体2与变异体1相比,在其编码区的第501碱基处,出现了一段375 bp的插入片段,该插入片段的第46～48个碱基为TAG,使翻译提前终止;变异体3与变异体2相比,在其编码区的第428碱基处,出现一段115 bp插入片段,该插入片段的第5～7个碱基为TGA,使翻译提前终止。3种转录变异体的核苷酸序列同源性为86.45%,氨基酸序列同源性为87%。冷诱导后,CIRP基因在肌肉中的表达水平出现显著升高(P<0.05)。

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