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芫荽NPR1-like家族全基因组鉴定及分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王葆生 1 ; 庞杰 1 ; 廉勇 1 ; 刘晓蕊 1 ; 扈顺 1 ; 刘湘萍 1 ;

作者机构： 1.内蒙古自治区农牧业科学院蔬菜花卉研究所

关键词： 芫荽;NPR1-like;基因家族;生物信息学

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2022 年 013 期

页码： 103-111

收录情况： 北大核心

摘要： 为研究芫荽NPR1-like基因家族的进化和功能，利用生物信息学手段，从芫荽全基因组中鉴定出7个NPR1-like基因，将其命名为CsNPR1～7,并对其理化性质、系统发生关系、保守结构域、基因结构、启动子区顺式作用元件和表达模式进行预测和分析。结果表明，芫荽7个NPR1-like基因家族成员在进化上分为CladeⅠ、CladeⅡ和CladeⅢ共3个分支，序列中有典型的BTB/POZ和锚蛋白重复结构域，含有1～3个内含子。芫荽NPRs不仅在蛋白序列中涉及构象变化、核定位及水杨酸（SA）结合等核心功能位点与拟南芥高度保守，而且在基因结构上也与拟南芥NPRs相似，暗示着二者可能具有类似的功能。CsNPRs基因启动子区域含有与激素响应、逆境胁迫和植物生长发育相关的顺式作用元件。基因表达分析结果显示，CsNPRs的表达部位和时期各不相同，暗示着芫荽NPR1-like基因家族成员可能在调控芫荽不同组织和不同时期生长发育过程中发挥不同作用。

  • 相关文献

[1]谷子HSP70基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析. 张古文,刘莉莉,王显瑞,柴晓娇,李书田. 2015

[2]山羊紧密连接相关蛋白ZO-1序列的生物信息学分析. 王梦雅,赵学亮,徐明,李洋,宋利文,高峰,胡红莲,高民. 2018

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