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黄鲷线粒体COⅠ基因部分序列遗传变异研究

文献类型： 中文期刊

作者： 张凤英 1 ; 夏连军 1 ; 马凌波 1 ; 施兆鸿 1 ; 马春艳 1 ;

作者机构： 1.农业部海洋与河口渔业重点开放实验室中国水产科学研究院东海水产研究所

关键词： 黄鲷Taiustumifrons;线粒体DNA;细胞色素氧化酶Ⅰ亚基(COⅠ)基因;序列分析

期刊名称： 热带海洋学报

ISSN： 1009-5470

年卷期： 2005 年 24 卷 05 期

页码： 85-91

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对采自中国东海外海和日本海的黄鲷Taius tumifrons线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ亚基(COⅠ)基因进行了研究。利用通用引物对该序列进行了PCR扩增,去掉两端引物及部分序列共得到590bp的碱基片断,其中A、T、G、C平均含量分别为30.4%、24.3%、25.0%和20.3%,A+T(54.7%)高于G+C(45.3%)含量。在获得的9个序列中共发现有156个碱基存在变异,其中包括42处简约信息位点,没有发现碱基的插入和缺失,序列中的转换大于颠换。实验结果显示,个体间的遗传距离在0—0.223 6之间,c3和j3与其它个体相比遗传差异明显。2群体间平均遗传距离为0.089 7,而东海和日本海群体内的平均遗传距离分别为0.086 9和0.113 3,说明黄鲷个体间遗传差异较大,但群体间的遗传差异不明显。

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