您好,欢迎访问中国水产科学研究院 机构知识库!

基于线粒体COI和D-loop序列的黑龙江流域蛇(鱼句)种群遗传结构分析

文献类型: 中文期刊

作者: 胡宗云 1 ; 杨培民 1 ; 宋红梅 2 ; 牟希东 2 ;

作者机构: 1.辽宁省淡水水产科学研究院辽宁省水生动物病害防治重点实验室

2.中国水产科学研究院珠江水产研究所农业农村部休闲渔业重点实验室

关键词: 蛇(鱼句)(Saurogobio dabryi);COI;D-loop;遗传多样性;遗传结构

期刊名称: 淡水渔业

ISSN: 1000-6907

年卷期: 2023 年 002 期

页码: 12-20

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以线粒体COI和D-loop序列为分子标记,基于88个样本研究了黑龙江流域3个蛇(鱼句)(Saurogobio dabryi)种群的遗传多样性和遗传结构。结果表明,比对剪切后的COI和D-loop序列长度分别为582~583 b、834~583 b,基于COI序列总体的单倍型多样性(0.377 3)略低于基于D-loop序列的单倍型多样性(0.577 0),但基于两个序列总体的核苷酸多样性指数相等,且仅有0.000 9。群体间遗传距离分别为0.000 9(COI)和0.000 9~0.001 0(D-loop),群体间遗传分化指数分别为-0.004 9~0.007 6(COI)和-0.002 8~0.011 4(D-loop),遗传分化均不显著(P>0.05)。分子方差分析(AMOVA)显示,群体内遗传变异占总变异的100.02%(COI)和99.49%(D-loop),总的遗传变异主要源自群体内。单倍型系统发育树和TCS网络图表明,所有的单倍型随机地聚集在一起,没有形成明显的地理格局。中性检验和核苷酸错配分析显示,3个蛇(鱼句)群体历史上发生过种群扩张事件。综上,3个蛇(鱼句)群体遗传多样性水平相对较低,群体间没有显著的遗传分化,可以将3个群体视为一个遗传管理单元。这些发现将丰富蛇(鱼句)现有的遗传信息,并为制定黑龙江流域蛇(鱼句)资源保护策略提供参考。

  • 相关文献

[1]基于COI序列的长江中上游鲢6个地理群体遗传多样性分析. 沙航,罗相忠,李忠,邹桂伟,梁宏伟. 2018

[2]长江上游中华纹胸鮡遗传多样性及遗传结构研究. 张力文,田辉伍,陈大庆,刘绍平,段辛斌,汪登强. 2020

[3]基于线粒体COI基因的中华鳖3个品系遗传多样性分析. 梁宏伟,曹力欢,罗相忠,朱成骏,崔峰,邹桂伟. 2021

[4]基于线粒体控制区的中国近海棘头梅童鱼群体遗传结构研究. 梁述章,宋炜,马春艳,蒋科技,张凤英,赵明,马凌波. 2019

[5]基于Cytb与D-loop的罗非鱼选育群体遗传结构对比分析. 颉晓勇,钟金香,李思发. 2014

[6]栉孔扇贝、虾夷扇贝及其杂交子代线粒体COI和Cytb基因遗传多样性分析. 于涛,吴彪,杨爱国,周丽青,刘志鸿. 2016

[7]基于线粒体16S rRNA和COI序列的江苏启东海域4种贝类遗传多样性分析. 闫永斌,葛玉双,程起群,范瑞良,李楠楠,全为民. 2022

[8]东黄海沙海蜇群体线粒体COI基因序列多态性. 刘敏,程家骅,马凌波,凌建忠,李建生. 2010

[9]我国不同地理群体栉江珧遗传多样性及系统发生分析. 严加坤,杨爱国,周丽青,吴彪,白临建,刘志鸿. 2013

[10]基于COI序列比较中国和科威特养殖鲳鱼群体的遗传差异. 孙鹏. 2015

[11]长江流域4个野生大眼鳜群体的遗传多样性分析. 程起群,吕浩,逄娇慧,赵金良. 2019

[12]长江流域4个野生大眼鳜群体的遗传多样性分析. 程起群,吕浩,逄娇慧,赵金良. 2019

[13]中国达氏鳇野生群体和两个养殖群体的线粒体遗传多样性分析. 户国,程磊,马波,孙大江,王斌,刘晓勇,柳淑芳,张颖. 2018

[14]基于多个线粒体序列的中韩俄沿海不同地理群体刺参的遗传多样性及种群结构分析. 王锦锦,廖梅杰,李彬,王印庚,荣小军,张正,葛建龙. 2020

[15]结合线粒体D-loop序列和SSR标记对宝石鲈养殖群体遗传多样性的分析. 赵立祥,董浚键,孙成飞,田园园,胡婕,卢迈新,叶星. 2019

[16]长江中上游4个鲢群体遗传多样性分析. 陈会娟,刘明典,汪登强,董微微,吕浩,陈大庆,李云. 2018

[17]长江中下游湖泊短颌鲚线粒体控制区遗传多样性分析. 王旭歌,何勇凤,吴兴兵,杨德国. 2018

[18]基于线粒体D-loop基因的中国海三疣梭子蟹遗传多样性与遗传分化研究. 董志国,李晓英,王普力,王文进,张庆起,阎斌伦,孙效文. 2013

[19]基于线粒体D-loop区探讨我国养殖大口黑鲈的分类地位和遗传变异. 李胜杰,白俊杰,叶星,简清,宋红梅. 2008

[20]利用线粒体D-loop基因序列分析黑龙江上游北极茴鱼群体遗传结构. 马波,范兆廷. 2013

作者其他论文 更多>>