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花椰菜苗期黑腐病抗、感品种转录组差异表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 姚玉荣 1 ; 霍建飞 1 ; 郝永娟 1 ; 贲海燕 1 ; 王万立 1 ;

作者机构： 1.天津科润农业科技股份有限公司/蔬菜种质创新国家重点实验室

关键词： 花椰菜;黑腐病;转录组;差异表达基因

期刊名称： 山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2020 年 007 期

页码： 1-6

摘要： 为研究花椰菜抗黑腐病的分子机制,本试验利用Illumina测序平台的RNA-Seq技术对花椰菜黑腐病感病品种Y1-2和抗病品种EC-247接种黑腐病菌5 d后的样本进行高通量转录组分析,采用RSEM软件计算基因表达量,并在此基础上筛选两组样本间的差异表达基因.结果显示,抗、感品种间差异表达基因共3 195个,其中上调表达基因1 424个,下调表达基因1 771个.通过GO和KEGG进行基因功能显著性富集分析发现,差异表达基因主要富集于苯丙烷类代谢、次级代谢产物合成、逆境响应、MAPK信号通路等途径.本研究结果可为解析花椰菜与黑腐病互作机制、挖掘黑腐病抗病基因提供参考.

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