文献类型： 中文期刊

作者： 蒋礼玲 ¹ ; 王琳超 ² ; 黄新荣 ¹ ; 杨宇若 ² ; 王明雪 ¹ ; 贾举庆 ³ ; 黄胜雄 ¹ ;

作者机构： 1.三江源生态与高原农牧业国家重点实验室/青海大学农林科学院/农业农村部作物基因资源与种质创新青海科学观测试验站/国家作物种质复份库

2.四川大学生命科学学院

3.山西农业大学农学院

关键词： 藜属;叶绿体基因组;变异位点;重复序列;系统进化

期刊名称： 应用与环境生物学报

ISSN： 1006-687X

年卷期： 2022 年 28 卷 005 期

页码： 1255-1261

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 高等植物的叶绿体基因组主要遗传自母本,具有基因组小、结构简单、序列高度保守等特点.利用系统的生物信息学方法,对4种藜属植物的叶绿体基因组进行编码基因组成、基因组结构、重复序列、变异位点在内的比较基因组学研究,以及基于叶绿体基因组序列的藜亚科植物的系统进化研究.结果表明,4种藜属植物叶绿体基因组平均大小为151 936 bp,平均GC含量为37.16%,具体基因的拷贝数和总的基因数目差异很小,非常保守.除灰绿藜以外,其余3种藜属植物叶绿体基因组的LSC、SSC和IR区域的边界几乎完全一致,没有表现出明显的扩张与收缩.基因组的重复序列中,相较于SSR,长重复序列片段的比例更高.相比较IR区域,4种藜属植物的LSC和SSC区域之间存在更大的核苷酸位点差异;52-59 kb的基因组区域为4种藜属植物间核苷酸位点变异最大的区段.基于全基因组和LSC+SSC序列,分别构建了包括4种藜属植物在内的藜亚科植物的系统进化树,进化关系完全一致.本研究结果揭示了藜属植物叶绿体基因组的进化特征,可为藜属植物系统进化研究提供优良的候选分子标记.