文献类型： 中文期刊
作者： 赵德胜 1 ; 张崇志 1 ;
作者机构： 1.包头轻工职业技术学院食品药品工程学院;内蒙古自治区农牧业科学院动物营养与饲料研究所
关键词： 家畜;全基因组关联分析(GWAS);统计方法;通路分析
期刊名称： 中国畜牧兽医
ISSN： 1671-7236
年卷期： 2018 年 02 期
页码： 463-470
收录情况： 北大核心
摘要： 全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是一种研究经济性状候选基因的分析方法。近年来,随着家畜全基因组测序的完成,大量的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)被标识,GWAS也越来越多地应用于家畜重要性状的研究领域中,在动物遗传育种中,通过对家畜基因组进行GWAS分析研究,找到控制家畜主要经济性状的重要SNPs,从而挖掘重要经济性状的候选基因。作者详细综述了GWAS的分析方法及其在重要家畜育种中的研究进展。GWAS分析方法包括基因组控制法(genommic control)、分层分析法(stratification analysis)、主成分分析法(principal components analysis,PAC)和混合线性模型分析法(mixed-linear-model association,MLMA),通路分析方法包括非核算法(基因功能富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)和分层贝叶斯优取(hierarchical Bayes prioritization,HBP))和核算法。依据不同的目标性状选择合理的分析方法,提高GWAS分析结果的准确性,为进一步利用GWAS分析各种性状的遗传基础提供合理的借鉴。
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