您好,欢迎访问中国水产科学研究院 机构知识库!

不同规格黄鳍金枪鱼红肌转录组比较分析

文献类型: 中文期刊

作者: 闫路路 1 ; 郭杰匀 1 ; 赵超 1 ; 王鹏飞 1 ; 张博 1 ; 邱丽华 1 ; 陈作志 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院南海水产研究所

关键词: 黄鳍金枪鱼;能量代谢;肌动蛋白;RNA-Seq;红肌;“恒温”表型

期刊名称: 海洋渔业

ISSN: 1004-2490

年卷期: 2024 年 001 期

页码: 1-10

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为探究黄鳍金枪鱼(Thunnus albacores)由“变温”型发育为“恒温”型的分子调控过程,基于RNA-Seq技术,对不同发育阶段黄鳍金枪鱼红肌组织RNA进行转录组测序并进行生物信息学分析。结果发现,与“变温”型相比,“恒温”型黄鳍金枪鱼红肌中43个差异表达基因表达量显著上调,79个显著下调。随机选取8个差异表达基因用qRT-PCR方法验证其相对表达量,发现与转录组测序结果相符。通过GO富集分析发现,差异表达基因富集在肌球蛋白复合体、肌动蛋白细胞骨架和横纹肌细丝等与肌肉运动密切相关的GO条目中。通过KEGG富集分析发现,差异表达基因富集在心肌收缩、磷酸戊糖途径和生热等与肌肉运动和能量代谢相关的通路上。结果表明,黄鳍金枪鱼“恒温”发育过程是一个涉及多组织、多基因的复杂过程,能量代谢和肌肉运动在这一过程中可能起到非常重要的作用。研究结果可以为今后深入开展黄鳍金枪鱼发育调控机制研究提供参考。

  • 相关文献

[1]热带印度洋黄鳍金枪鱼水平-垂直分布空间分析. 杨胜龙,化成君,靳少非,范秀梅,张胜茂,伍玉梅. 2014

[2]热带大西洋黄鳍金枪鱼垂直分布空间分析. 杨胜龙,马军杰,吴晓芬,王晓璇,范秀梅,樊伟. 2015

[3]中西太平洋延绳钓黄鳍金枪鱼渔场时空分布与温跃层关系. 杨胜龙,张忭忭,靳少非,樊伟. 2015

[4]大西洋中部延绳钓黄鳍金枪鱼渔场时空分布与温跃层的关系. 杨胜龙,马军杰,张禹,化成君,戴阳. 2013

[5]黄鳍金枪鱼垂直移动及水层分布研究进展. 杨胜龙,张忭忭,张衡,张胜茂,伍玉梅,周为峰,冯春雷. 2019

[6]黄鳍金枪鱼5月龄幼鱼形态性状对体质量的相关性及通径分析. 方伟,周胜杰,赵旺,杨蕊,胡静,于刚,马振华. 2021

[7]热带中西太平洋黄鳍金枪鱼栖息水层空间分析. 杨胜龙,史慧敏,范秀梅,崔雪森,王斐,张衡. 2022

[8]黄鳍金枪鱼体质量与消化酶和免疫相关酶活性的关系研究. 周胜杰,杨蕊,于刚,马振华. 2022

[9]南海金枪鱼和鸢乌贼资源开发现状及前景. 张鹏,杨吝,张旭丰,谭永光. 2010

[10]黄鳍金枪鱼幼鱼体质量与血液指标关系研究. 刘鸿雁,付正祎,于刚,马振华. 2023

[11]基于ADASYN和Stacking集成的南太平洋黄鳍金枪鱼渔场预报模型研究. 张聪,周为峰,樊伟. 2023

[12]黄鳍金枪鱼资源利用状况分析. 苗振清,黄锡昌. 2003

[13]基于贝叶斯分类器的南海黄鳍金枪鱼渔场预报模型. 周为峰,黎安舟,纪世建,邱永松,郑汉丰. 2018

[14]南海及临近海域黄鳍金枪鱼渔场时空分布与海表温度的关系. 纪世建,周为峰,王鲁民,唐峰华,吴祖立,陈国宝. 2016

[15]中西太平洋海山特征对延绳钓渔业和围网渔业黄鳍金枪鱼CPUE的影响. 费姣姣,李成,张健,滕钰秀,吴蕴韬,石建高. 2024

[16]金枪鱼养殖研究进展. 戴世明,周胜杰,于刚,马振华. 2023

[17]中西太平洋金枪鱼围网黄鳍金枪鱼渔获时空分析. 沈建华,崔雪森. 2006

[18]黄鳍金枪鱼幼鱼日周期性及摄食期间的运动行为规律. 周胜杰,杨蕊,于刚,马振华. 2022

[19]中国南海黄鳍金枪鱼(Thunnus albacares)幼鱼形态特征及其与体重的关系. 李炎璐,陈超,于宏,孙曙光,孟祥君,孔祥迪. 2016

[20]印度洋大眼金枪鱼、黄鳍金枪鱼延绳钓渔场重心变化分析. 曹晓怡,周为峰,樊伟,李圣法. 2009

作者其他论文 更多>>