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百合斑驳病毒靖宇分离物全基因组序列测定与进化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张春雨 1 ; 李小宇 1 ; 王晨 1 ; 黄瑞贤 2 ; 黄淑敏 2 ; 王永志 1 ;

作者机构： 1.吉林省农业科学院(中国农业科技东北创新中心)植物保护研究所

2.靖宇县农业技术推广中心

关键词： 百合斑驳病毒;基因组

期刊名称： 北方园艺

ISSN：

年卷期： 2023 年 024 期

页码： 59-64

收录情况： 北大核心

摘要： 以采自吉林省白山市靖宇县的野生百合感病叶片为试材，采用小RNA深度测序法检测到1株百合斑驳病毒（Lily mottle virus,LMoV）,采用分段克隆方法，对LMoV靖宇分离物（LMoV-JY）的全基因组进行测定并分析，以期对吉林省百合病毒病的检测和防控提供参考依据。结果表明：LMoV-JY基因组大小为9 648个核苷酸（nt）序列（GenBank登录号MT795719）,该核苷酸序列在第154～9 444位存在1个大的开放阅读框（ORF）,编码1个多聚蛋白（分子量351.46 kD）。LMoV-JY与GenBank中登录的其他LMoV分离物的全基因组核苷酸序列比较，其一致性为82.82%～97.85%,在氨基酸水平上的一致性为92.96%～98.64%,其中与百合斑驳病毒大连分离物LMoV-DL（HM222521）的一致性在该2种水平上均为最高。对比LMoV-JY外壳蛋白与其他54个分离物的氨基酸序列，发现可将LMoV分离物分为2个类群。

  • 相关文献

[1]八种植物线粒体基因组结构特征分析与比较. 李玉秋,赵洪锟,谭化,刘晓东,张春宝,董英山. 2011

[2]双斑萤叶甲基因组调研及线粒体基因组分析. 姜志磊,王大铭,王柏凤,宋新元. 2019

[3]侵染大豆的花生斑驳病毒公主岭分离物基因组测序及分析. 张春雨,李小宇,王晨,战笑蕾,刘建青,王永志. 2022

[4]大豆基因组F连锁群较高密度图谱的构建和基因定位. 刘峰,陈受宜,庄炳昌. 2000

[5]用栽培大豆与半野生大豆间的杂种F2群体构建基因组分子标记连锁…. 张德水,庄炳昌. 1997

[6]大豆遗传图谱的构建和分析. 刘峰,庄炳昌,张劲松,陈受宜. 2000

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