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甘蓝型油菜恢复系的群体结构解析及核心种质构建

文献类型: 中文期刊

作者: 张格格 1 ; 柳海东 1 ; 杜德志 1 ;

作者机构: 1.青海大学农林科学院青藏高原种质资源研究与利用实验室国家油料改良中心青海分中心青海省春油菜遗传改良重点实验室青海省春油菜工程技术研究中心农业农村部春油菜科学观测实验站

关键词: 甘蓝型油菜;春油菜;全基因组重测序;群体结构;核心种质

期刊名称: 中国油料作物学报

ISSN: 1007-9084

年卷期: 2023 年 002 期

页码: 231-239

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为加快选育适应春油菜区的强优势杂交种,解析甘蓝型油菜恢复系的群体结构及构建核心种质,利用全基因组重测序技术对144份恢复系组成的群体进行全基因组扫描,利用3 881 462个SNP标记,计算材料间的遗传距离,确定最优分群数,评估连锁不平衡程度,采用分层取样的方法,结合等位基因数目最大化策略,构建核心种质。结果表明,基于遗传距离和群体结构两种方法,可将群体划分为7类。整个群体中连锁不平衡程度较低。利用CoreHunter软件构建了C30和C40两个较优核心子集,C30包括44份种质资源,C40包括59份。通过评价,核心种质等位基因覆盖度均达到99%,多态信息含量达到0.24,C30和C40这两个核心子集均能代表144份甘蓝型油菜原始种质,其中C30可确定为最终的核心子集,用于亲本杂优分析。

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