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基于线粒体COI基因的毛蚶群体遗传多样性

文献类型: 中文期刊

作者: 田吉腾 1 ; 侯丫 1 ; 刘志鸿 1 ; 杨爱国 1 ; 吴彪 1 ; 周丽青 1 ; 董春光 1 ;

作者机构: 1.农业部海洋渔业可持续发展重点实验室

关键词: 毛蚶(Scapharca subcrenata);COI基因;群体;遗传多样性

期刊名称: 海洋科学

ISSN: 1000-3096

年卷期: 2016 年 40 卷 01 期

页码: 1-9

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用PCR技术,扩增了大连、乳山、烟台、舟山4个毛蚶(Scapharca subcrenata)地理群体共38个个体的线粒体COI基因部分序列,并分析了4个毛蚶群体的遗传多样性和系统发育关系。研究结果显示:38个毛蚶COI部分序列经处理得到长度均为625bp的基因片段,共分为30种单倍型;基于COI部分序列的分析结果,毛蚶4个地理群体总的变异位点为301个,多样性指数Pi为0.15048,平均核苷酸差异数为92.242,单倍型多样性指数S为241。聚类分析显示毛蚶大连群体、乳山群体和烟台群体具有高度的遗传多样性,3个群体交叉聚在一起,没有明显的群体分化;舟山群体单独聚为一支,与其他3个群体分化明显。研究表明,线粒体COI基因不能单独做为毛蚶大连、乳山和烟台群体的遗传标记,但可以作为毛蚶舟山群体的有效群体遗传标记,为线粒体COI基因在群体遗传学的应用提供了基础资料。

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