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基于D-loop序列和SSR的从江田鱼与6个鲤群体的遗传分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张显波 1 ; 傅建军 2 ; 胡锦丽 1 ; 朱文彬 2 ; 闵倩雯 1 ; 赵飞 1 ; 吴俣学 1 ; 董在杰 2 ;

作者机构: 1.贵州省农业科学院水产研究所

2.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室

关键词: 从江田鱼;群体;线粒体D-loop;微卫星;遗传多样性

期刊名称: 贵州农业科学

ISSN: 1001-3601

年卷期: 2021 年 012 期

页码: 76-85

收录情况: 北大核心

摘要: 【目的】探明从江田鱼的遗传背景及其多样性水平,为进一步开展系统选育提供数据参考。【方法】采用D-loop序列和11个SSR标记开展从江田鱼(CJTY)与清水江鲤(QSJ)、太湖鲤(THL)、黄河鲤(HHL)、黑龙江鲤(HLJ)、福瑞鲤(FRL)及松浦镜鲤(SPL)等6个鲤群体的遗传分析。【结果】长度为932 bp的D-loop片段上有46个多态性位点,共定义41个单倍型,其中CJTY有16个单倍型;CJTY的核苷酸遗传多样性π值为0.005,单倍型多样性Hd为0.829,高于FRL和SPL,但低于其余4个鲤群体,CJTY的多态信息含量(PIC)为0.82,高于FRL(0.73)和SPL(0.50),但低于其他4个鲤群体,CJTY的期望杂合度(He)为0.90,低于QSJ(0.93)和THL(0.92),高于其他4个鲤群体;遗传分化指数(FST值)显示CJTY与QSJ、THL、HHL、HLJ的分化程度较低,与FRL呈中度遗传分化,与SPL呈高度遗传分化,FRL和SPL各为1个亚群,其余5个群体为1个亚群;群体间遗传距离分析结果与FST结果相符。【结论】从江田鱼的遗传多样性水平高于2个人工选育群体(FRL和SPL),低于4个野生群体(QSJ、THL、HHL和HLJ);从江田鱼具有相对独立的地理分布区域和特定养殖模式等特点,受到一定程度自然选择或人工选择压力,但未经系统选育实践,尚保留较高遗传多样性水平,具有进一步遗传改良的潜力。

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