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脊尾白虾丝氨酸羟甲基转移酶基因的克隆及其表达特征分析

文献类型: 中文期刊

作者: 孙金秋 1 ; 徐莞媛 1 ; 马杭柯 1 ; 高威 1 ; 欧阳乐飞 1 ; 高焕 1 ; 阎斌伦 1 ;

作者机构: 1.江苏省海洋大学江苏省海洋生物资源与生态环境重点实验室江苏省海洋生物技术重点实验室;江苏省海洋生物产业技术协同创新中心;江苏省农业种质资源保护与利用平台;江苏省海洋资源开发研究院(连云港)

关键词: 脊尾白虾;丝氨酸羟甲基转移酶基因;基因克隆;组织表达;Cd2+胁迫

期刊名称: 渔业科学进展

ISSN: 2095-9869

年卷期: 2020 年 01 期

页码: 127-134

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究根据脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)转录组序列,采用c DNA末端快速扩增技术克隆获得了脊尾白虾丝氨酸羟甲基转移酶基因(SHMT)。该基因c DNA全长为1855 bp,其中,开放阅读框为1407 bp,5?端非编码区为39 bp,3?端非编码区为409 bp,共编码468个氨基酸,预测蛋白质的分子质量为152.55 kDa,理论等电点为4.90。同源性分析显示,脊尾白虾SHMT基因与甲壳类动物真宽水蚤(Eurytemora affinis)同源性最高,为96%。荧光定量分析结果显示,SHMT基因在脊尾白虾眼柄、胃、肝胰腺、心脏、鳃、肠、肌肉、腹索神经、皮下脂肪以及卵巢中均有表达,其中,卵巢表达量最高,心脏次之。不同浓度Cd2+胁迫结果显示,其在低浓度(0.0100、0.0175和0.021 mmol/L)Cd2+胁迫中的表达模式基本一致,呈先升高后下降再升高再下降的趋势;而在高浓度(0.0278 mmol/L)Cd2+胁迫中,该基因表达量很低,甚至不表达,说明高浓度Cd2+胁迫可以抑制该基因的表达,具体机制有待进一步研究。

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