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大白菜霜霉菌诱导抑制性消减杂交cDNA文库的构建和分析

文献类型: 中文期刊

作者: 唐永洽 1 ; 于拴仓 2 ; 朱月林 2 ; 张凤兰 2 ; 余阳俊 2 ; 赵岫云 2 ; 张德双 2 ;

作者机构: 1.南京农业大学园艺学院

2.南京农业大学园艺学院;北京市农林科学院蔬菜研究中心

关键词: 大白菜;霜霉病;抑制性消减文库;实时荧光定量PCR

期刊名称: 植物生理学通讯

ISSN: 0412-0922

年卷期: 2010 年 46 卷 05 期

页码: 453-458

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以抗霜霉病大白菜双单倍体系(DH)‘T12-19’为材料,构建了霜霉病诱导表达的正向抑制性消减文库,并利用反向Northern斑点杂交技术对768个阳性克隆进行了筛选,共获得57个病原菌诱导上调表达的克隆。测序后得到55条通读表达序列标签(ESTs),对这些ESTs序列进行聚类和拼接分析,共获得50个unigenes。Blast分析表明,37个unigenes与已知基因高度同源,占全部非重复序列的67.3%。对已知功能基因按MIPS的分类方法进行功能分类,发现这些基因的功能主要涉及物质与能量代谢、转录调控、蛋白质合成与代谢、膜及转运、信号转导、抗病防御等。为了验证文库筛选结果的可靠性,采用实时荧光定量PCR技术分析了其中2个克隆BFCH10和BFIA7的表达谱。结果表明,这2个克隆在接种病菌6h后明显上调表达,与反向Northern斑点杂交结果基本一致。

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