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基于SSR标记贵州古茶树资源的遗传多样性分析及指纹图谱构建

文献类型: 中文期刊

作者: 郭燕 1 ; 刘声传 1 ; 曹雨 1 ; 赵华富 1 ; 魏杰 1 ; 鄢东海 1 ; 周富裕 1 ;

作者机构: 1.贵州省农业科学院茶叶研究所

关键词: 古茶树资源;SSR;遗传多样性;指纹图谱;贵州

期刊名称: 西南农业学报

ISSN: 1001-4829

年卷期: 2016 年 29 卷 03 期

页码: 491-497

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了贵州古茶树资源的有效保护和充分利用提供理论依据,采用EST-SSR标记对40份贵州古茶树资源进行了遗传多样性分析和分子指纹鉴定。结果表明:20个SSR标记在40份资源中共检测到76个等位基因,平均每个标记3.8个,PIC和Shannon信息指数平均值分别为0.462和0.936,多态性适中。76个等位基因在参试古茶树资源中的出现频率差异较大,变异范围为1.32%~89.74%。参试材料的Nei's遗传距离(D)为0.075~0.875,当D≈0.160时,40份古茶树资源可聚为6类,包括3个单独聚类和3个复合聚类。利用4个核心标记即可鉴定40份古茶树资源,并根据等位基因带型,获得18位数的分子指纹图谱号码,构建每份资源的分子指纹图谱。

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