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基于SSR标记的草莓品种DNA指纹图谱的构建及应用

文献类型: 中文期刊

作者: 黄志城 1 ; 石敬韡 2 ; 庞夫花 2 ; 王显生 2 ; 赵密珍 2 ; 陈海荣 3 ;

作者机构: 1.上海市农业科学院农产品质量标准与检测技术研究所农业部植物新品种测试(上海)分中心;江西农业大学;江苏省农业科学院

2.;上海市农业科学院农产品质量标准与检测技术研究所农业部植物新品种测试(上海)分中心;江西农业大学;江苏省农业科学院

3.;上海市农业科学院农产品质量标准与检测技术研究所农业部植物新品种测试(上海)分中心;江西农业大学;江苏省农业科学院;

关键词: 草莓;SSR;荧光标记;DNA指纹

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2017 年 08 期

页码: 3097-3116

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以49份申请品种保护提供的品种和47份收集的草莓已知品种为材料,通过从208对草莓SSR引物中筛选出20对多态性好的核心引物,采用变性聚丙烯酰氨凝胶电泳检测和毛细光电泳检测相结合的方式对96份草莓品种进行标记分析,检测每个标记不同等位变异大小,并为每个等位变异选取了相应的参照品种。结果显示:20对引物共检测出206个等位位点,每对引物检测到等位位点6~15个平均10.3个;共检测到600个带型,每对引物检测到带型数11~58个,平均30个,平均多态性信息含量(polymorphism information content,PIC)为0.80。聚类结果表明,在遗传相似系数为0.96时,该套引物能将所有品种区分开,同一单位选育的品种被优先聚为一类;对历年草莓申请品种选择的近似品种做出合理性评价,并对今年新的部分申请品种推荐更为相近的近似品种,同时本研究中可能存在的"同名异物"和"同物异名"的品种还需基于外观表达性状的观测。

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