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Opaque2转录因子对玉米α-醇溶蛋白基因家族成员表达的影响

文献类型: 中文期刊

作者: 李国锋 1 ; 葛敏 2 ; 吕远大 2 ;

作者机构: 1.江苏省农业科学院六合基地

2.江苏省农业科学院农业生物技术研究所/江苏省农业生物学重点实验室

关键词: 玉米;α-醇溶蛋白;基因家族表达谱;Opaque 2

期刊名称: 江苏农业学报

ISSN: 1000-4440

年卷期: 2015 年 31 卷 06 期

页码: 1224-1231

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 醇溶蛋白是玉米主要的储存蛋白,其中α-醇溶蛋白含量最为丰富,对玉米籽粒品质有重要影响。本研究利用全基因组数据鉴定α-醇溶蛋白基因家族,并从基因保守motif、玉米籽粒不同发育时期基因的表达谱以及转录因子Opaque2对该家族成员表达的影响3个方面分析玉米α-醇溶蛋白基因家族。结果显示,玉米参考基因组中存在39个α-醇溶蛋白基因,其中z1A、z1B、z1C和z1D 4个亚族成员分别为12个、8个、14个和5个。基因保守motif分析发现该家族基因序列高度保守。表达谱分析结果显示该家族表达模式差异较大,其中z1A亚族在籽粒发育时期表达量最高。利用RNA-seq数据剖析在种子发育阶段Opaque 2(O2)野生型和突变体编码该家族成员的表达差异,结果显示O2突变体中z1C亚族成员表达显著下调,z1A亚族表达略有下调,z1B和z1D亚族成员表达量没有显著的变化。本研究在重新注释α-醇溶蛋白家族成员信息的基础上,对该家族的表达谱进行了分析,为今后玉米籽粒品质育种提供了必要遗传信息。

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