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鳗鲡肠道微生物抗性基因组成特征的初步分析

文献类型： 中文期刊

作者： 黄薇 1 ; 刘兰英 1 ; 罗土炎 1 ; 刘洋 1 ; 宋永康 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所/福建省农产品质量安全重点实验室

关键词： 鳗鲡;肠道微生物;抗生素抗性基因;宏基因组学

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2020 年 48 卷 021 期

页码： 57-62

收录情况： 北大核心

摘要： 肠道微生物是抗生素抗性基因(ARGs)的储存库,为明确ARGs在鱼肠道微生物中的组成特征,本研究以养殖鳗鲡为研究对象,利用高通量测序技术及功能宏基因组学分析方法对鳗鲡肠道微生物ARGs的种类和丰度进行了探究.研究结果显示,养殖鳗鲡肠道微生物主要由厚壁菌门(Firmicutes)、梭杆菌门(Fusobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)组成,比对抗性基因数据库共注释得到254种ARGs基因,分别归属于24类抗性类型,其中高丰度的抗性类型为多肽类抗生素、多重耐药、氟喹诺酮类、四环素类和β-内酰胺类.以上结果表明,在鳗鲡养殖过程中,出现耐多肽类抗生素、氟喹诺酮类、四环素类、β-内酰胺类以及多重耐药病原菌的机会相对较高.本研究为抗生素在鳗鲡养殖过程中合理使用提供参考依据,同时也显示宏基因组测序技术在检测鱼肠道ARGs的可行性和优越性.

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