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中国部分地区对虾白斑综合征病毒胶原蛋白基因缺失变异分析

文献类型: 中文期刊

作者: 秦梦雪 1 ; 刘庆慧 1 ; 万晓媛 1 ; 黄捷 1 ;

作者机构: 1.农业部海洋渔业可持续发展重点实验室

关键词: 白斑综合征病毒;胶原蛋白基因;缺失;变异;蛋白结构

期刊名称: 动物医学进展

ISSN: 1007-5038

年卷期: 2017 年 38 卷 01 期

页码: 21-27

收录情况: 北大核心

摘要: 为了解我国主要对虾养殖区的白斑综合征病毒(WSSV)胶原蛋白基因(wsv001)蛋白结构变异情况,以2015年13个省市发病地区采集的57份WSSV阳性样品为模板,用特异引物对目的片段进行扩增,连接转化扩增片段并进行测序分析。结果显示,57份WSSV阳性样品中,扩增出现条带的样品共有18份。氨基酸序列比对结果显示,扩增的wsv001片段所编码氨基酸出现三类变异,包括18个氨基酸小片段缺失,121个氨基酸大片段缺失及氨基酸插入,此外,还有8个氨基酸存在突变。结果表明,我国不同地区wsv001基因及其编码氨基酸存在明显缺失变异。对wsv001蛋白结构缺失变异的分析,为进一步对其蛋白功能和WSSV毒株毒力及WSSV对环境适应能力的研究提供参考。

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