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中国对虾微卫星DNA引物的设计及筛选

文献类型： 中文期刊

作者： 张天时 1 ; 刘萍 1 ; 孔杰 1 ; 王清印 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院黄海水产研究所

关键词： 中国对虾;微卫星;基因组文库;遗传多样性

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2004 年 11 卷 06 期

页码： 567-571

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据建立的中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)部分基因组文库,对筛选的含微卫星DNA序列的克隆设计了28对引物,筛选出5对微卫星多态性引物,并用这5对引物对中国对虾的养殖群体20个个体进行了遗传多样性分析。在这5个微卫星位点中,虽然RS0871位点是多态位点,但其等位基因数、杂合度和多态信息含量都比较低。其余4个微卫星位点可产生6-8个等位基因,等位基因的大小分布在142-364 bp,基本上符合引物设计时理论产物长度。这些微卫星位点的期望杂合度的范围为0.7577-0.8064,表明它们都有较高的杂合度。仅有位点RS0956的观察杂合度与期望值有较大的出入,其他微卫星位点的这两值基本相符。有4个微卫星位点的PIC值较高,在0.7180-0.7709。因此,除RS0871位点以外的4个微卫星位点均可用于中国对虾种群遗传结构分析,这将为中国对虾品种选育、种系评估提供更多的微卫星DNA信息。

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[1]中国对虾部分基因组文库构建和微卫星DNA序列的筛选. 刘萍,孟宪红,孔杰,李健,王清印. 2004

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[15]中国对虾黄渤海沿岸群亲本及子一代RAPD分析. 刘萍,孔杰,石拓,刘志鸿,邓景耀,庄志猛,徐怀恕,韩玲玲. 2000

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