文献类型: 中文期刊
作者: 洪晓如 1 ; 吴智明 1 ; 陈汉才 2 ; 黎庭耀 2 ; 沈卓 2 ; 张艳 2 ;
作者机构: 1.仲恺农业工程学院园艺园林学院
2.广东省农业科学院蔬菜研究所
关键词: 芥蓝(Brassica alboglabra);重测序;InDel标记
期刊名称: 分子植物育种
ISSN:
年卷期: 2021 年 004 期
页码: 1190-1201
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 碱基插入/缺失(InDel)在基因组中的分布密度仅次于SNP且易于基因型分型,成为分子标记开发的主要来源。为了开发芥蓝品种间有多态性的分子标记,本研究利用2份芥蓝自交系重测序数据鉴定的InDel位点,在全基因组范围内设计了367对InDel候选标记。通过PCR检测比较8个芥蓝自交系的多态性,发现284对标记在至少2个芥蓝自交系间有多态性,阳性率为77.4%。本研究利用重测序技术开发芥蓝品种间InDel标记效率较高,为种质资源分析、基因定位、分子标记辅助育种等提供了便捷工具。
- 相关文献
[1]基于重测序的菠萝基因组InDel标记的开发. 贺涵,刘传和,喻梦凡,袁梦萍,魏岳荣,杨敏,邝瑞彬,周陈平,吴夏明,徐泽. 2025
[2]4个籼稻品种苗期耐热性评价及分子机理分析. 叶婵娟,陈可,周新桥,陈达刚,郭洁,刘娟,曹哲,刘传光,陈友订,陈国荣. 2023
[3]豇豆抗锈病全基因组关联分析. 吴健,汪宝根,陈小央,吴晓花,李潇,韩磊,汪颖,王尖,鲁忠富,杨易,张艳,李国景,吴新义. 2024
[4]应用高分辨率熔解曲线技术分析水稻分子标记基因型. 赵均良,张少红,刘斌. 2011
[5]基于重测序的长豇豆基因组InDel标记开发及应用. 杨易,黎庭耀,李国景,陈汉才,沈卓,周轩,吴增祥,吴新义,张艳. 2022
作者其他论文 更多>>
-
辣椒胞质雄性不育恢复基因CAPS标记的PARMS转换及其应用
作者:陈金金;赵威;徐小万;衡周;王恒明;吴智明;徐晓美
关键词:辣椒;胞质雄性不育;恢复系;高通量;分子标记辅助选育
-
基于全基因组重测序的不结球白菜KASP分子标记开发与应用
作者:张艳;沈卓;杨易;周轩;吴增祥;黎庭耀
关键词:不结球白菜;KASP分子标记;遗传多样性分析;DNA指纹图谱
-
葫芦科作物遗传多样性研究进展
作者:程晓欣;闫晋强;翟许玲;吴智明;江彪
关键词:葫芦科;种质资源;遗传多样性
-
豇豆抗锈病全基因组关联分析
作者:吴健;汪宝根;陈小央;吴晓花;李潇;韩磊;汪颖;王尖;鲁忠富;杨易;张艳;李国景;吴新义
关键词:豇豆;锈病;关联分析;重测序
-
辣椒基因组学研究进展
作者:程蛟文;赖泽培;董骥驰;覃成;吴智明;廖毅;陈长明;宋钊;陈木溪;崔竣杰;宋建文;胡开林
关键词:辣椒;基因组学;种间分化;基因渗入;遗传多样性;人工驯化;扩张传播
-
冬瓜ARF4基因克隆及表达特性分析
作者:程晓欣;翟许玲;闫晋强;王宝琛;莫仁连;刘文睿;吴智明;江彪
关键词:冬瓜;ARF;果实发育;基因克隆;生物信息学;表达分析
-
基于SSR分子标记的‘汇丰2号’辣椒杂交种子纯度和真实性鉴定
作者:赵威;徐晓美;徐小万;衡周;王恒明;陈金金;吴智明
关键词:辣椒;‘汇丰2号’;种子纯度;SSR分子标记;真实性鉴定