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基于重测序的芥蓝(Brassica alboglabra)全基因组InDel标记开发

文献类型: 中文期刊

作者: 洪晓如 1 ; 吴智明 1 ; 陈汉才 2 ; 黎庭耀 2 ; 沈卓 2 ; 张艳 2 ;

作者机构: 1.仲恺农业工程学院园艺园林学院

2.广东省农业科学院蔬菜研究所

关键词: 芥蓝(Brassica alboglabra);重测序;InDel标记

期刊名称: 分子植物育种

ISSN:

年卷期: 2021 年 004 期

页码: 1190-1201

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 碱基插入/缺失(InDel)在基因组中的分布密度仅次于SNP且易于基因型分型,成为分子标记开发的主要来源。为了开发芥蓝品种间有多态性的分子标记,本研究利用2份芥蓝自交系重测序数据鉴定的InDel位点,在全基因组范围内设计了367对InDel候选标记。通过PCR检测比较8个芥蓝自交系的多态性,发现284对标记在至少2个芥蓝自交系间有多态性,阳性率为77.4%。本研究利用重测序技术开发芥蓝品种间InDel标记效率较高,为种质资源分析、基因定位、分子标记辅助育种等提供了便捷工具。

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