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豇豆抗锈病全基因组关联分析

文献类型: 中文期刊

作者: 吴健 1 ; 汪宝根 2 ; 陈小央 3 ; 吴晓花 2 ; 李潇 1 ; 韩磊 1 ; 汪颖 2 ; 王尖 2 ; 鲁忠富 2 ; 杨易 4 ; 张艳 4 ; 李国景 2 ; 吴新义 2 ;

作者机构: 1.浙江农林大学园艺科学学院

2.浙江省农业科学院蔬菜研究所/农业农村部南方豆类蔬菜种质创新与分子育种重点实验室(部省共建)

3.浙江省种子管理总站

4.广东省农业科学院蔬菜研究所

关键词: 豇豆;锈病;关联分析;重测序

期刊名称: 植物遗传资源学报

ISSN: 1672-1810

年卷期: 2024 年 25 卷 011 期

页码: 1907-1922

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 豇豆是世界范围内重要的豆类作物,在我国既是重要的杂粮作物,也是传统的豆类蔬菜作物。锈病是豇豆生产上三大主要病害之一,选育抗锈病品种是防治锈病最经济有效的策略,筛选抗锈病种质、解析其遗传基础是抗锈病育种的关键和前提。本研究对215份豇豆地方品种进行抗锈病精准鉴定,筛选出40份抗锈病种质。利用重测序技术鉴定了215份种质的基因型,获得3880169个高质量SNPs和469398个高质量InDels。群体结构分析将之分为4个亚群,亚群分类与荚长、荚型高度相关。采用全基因组关联分析,鉴定出10个与锈病抗性显著相关的基因组区段,分布在7条染色体上。单倍型分析显示各峰值SNP的不同等位变异与锈病抗性高度相关,且随着有利等位变异的聚合,群体内抗病材料的比例显著升高。本研究鉴定出10个可能的抗锈病候选基因,包括含BTB/POZ结构域蛋白基因、LRR受体类丝氨酸/苏氨酸激酶基因、乙烯反应转录因子、交替氧化酶基因等。本研究为豇豆抗锈病分子育种提供了理论指导和基因资源。

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