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基于加权基因共表达网络分析探究桑树光合相关基因的调控模式

文献类型： 中文期刊

作者： 李勇 1 ; 黄锦 1 ; 于翠 1 ; 莫荣利 1 ; 朱志贤 1 ; 董朝霞 1 ; 胡兴明 1 ; 邓文 1 ;

作者机构： 1.湖北省农业科学院经济作物研究所

关键词： 加权基因共表达网络分析;桑树;光合相关基因

期刊名称： 湖北农业科学

ISSN： 0439-8114

年卷期： 2022 年 61 卷 024 期

页码： 163-169

收录情况： 北大核心

摘要： 基于前期桑树转录组数据和光合表型数据,通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)共获得10个基因模块与表型关联,筛选到MEmagenta、MEgreen、MEyellow、MEpurple和MEblack光合相关基因模块.GO和KEGG分析显示,DEGs显著富集在光合相关酶活性、碳代谢和固碳等途径,筛选到12个与光合作用高度相关的基因.通过RNA-seq结合WGCNA分析,筛选了3个光合关键基因,即光系统Q(B)蛋白L484_000029基因、核糖二磷酸羧化酶L484_000836基因、核糖二磷酸羧化酶/加氧酶激活酶2 L484_025354基因.该结果为进一步研究桑树光合作用调控机理提供支持.

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[2]桑树青枯病的发生与防治研究进展. 董朝霞,于翠,邓文,胡兴明. 2019

[3]桑树抗逆性分子机制研究进展. 朱志贤,于翠,李勇,莫荣利,邓文,胡兴明. 2017

[4]鄂西南蚕区桑树栽培现状与发展建议. 李勇,邓文,于翠,莫荣利,朱志贤,胡兴明. 2017

[5]新疆天山以北和南坡桑树自然区种质资源收集与保存. 李勇,莫荣利,黄锦,于翠,朱志贤,董朝霞,胡兴明,邓文. 2021

[6]施肥对青枯病不同抗性桑树根际微生物及土壤理化性质的影响. 董朝霞,郭瑶,于翠,朱志贤,莫荣利,李勇,邓文,熊超,胡兴明. 2020

[7]桑树与红薯套作模式的群体光合特性研究. 李勇,于翠,胡兴明,邓文,叶楚华. 2013

[8]农业气象灾害对桑树的影响及应对措施. 吴恢,叶楚华. 2010

[9]桑树品种育71-1的光合特性研究. 郭冬各,于翠,李勇,邓文,熊超,叶楚华,彭波,胡兴明. 2012

[10]桑树专用有机无机复混肥试验示范. 于翠,李勇,邓文,胡兴明,莫荣利,熊超. 2016

[11]桑树生物碱研究进展. 吴洪丽,郝瑜,周洪英,孙波. 2016

[12]人工四倍体桑树品种鄂桑2号的光合特性研究. 邓文,于翠,彭波,李勇,黄淑君. 2012

[13]桑黄的类型、功用及开发利用. 周洪英,孙波,吴洪丽,叶建美,许淑琼,胡兴明. 2014

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[17]桑树耐盐性研究进展. 于翠,胡兴明,邓文,叶楚华,熊超. 2012

[18]桑树根结线虫病的综合防治. 徐有海,彭波,胡兴明,邓文,叶楚华. 2011

[19]桑树对大气中二氧化硫和氟化物的抗性及吸收能力研究. 吴洪丽,郝瑜,刘岚,许淑琼,叶楚华,孙波,周洪英,叶建美. 2015

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