文献类型： 中文期刊

作者： 崔梦杰 ¹ ; 王晨 ¹ ; 冷翔鹏 ¹ ; 吴伟民 ¹ ; 汤崴 ¹ ; 张文颖 ¹ ; 朱旭东 ¹ ; 贾海锋 ¹ ; 沈文飚 ¹ ; 房经贵 ¹ ;

作者机构： 1.南京农业大学园艺学院;江苏省农业科学院;南京农业大学生命科学学院

关键词： 葡萄;SBP-box;转录因子;生物信息学分析;表达分析

期刊名称： 南京农业大学学报

ISSN： 1000-2030

年卷期： 2018 年 03 期

页码： 429-439

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]本文旨在分析已知葡萄(Vitis vinifera L.)SBP-box家族基因基本信息,研究其在葡萄果实发育成熟过程中的调控作用。[方法]利用葡萄转录因子Plant TF数据库(http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/index.php?sp=Vvi)查询并获得SBP-box基因,采用ClustalX 2、DNAMAN 6、Web Logo 3、MEGA 4.1和Gene Structure Display Server等软件对其基因与蛋白序列进行生物信息学分析。利用Plantcare软件分析葡萄转录因子SBP-box家族成员的启动子元件,预测其与果实发育及成熟过程相关的潜在作用。采用RT-qPCR技术研究VvSBP基因在果实发育成熟过程中的作用。[结果]从转录因子数据库中共得到19个葡萄SBP-box基因。SBP-box结构域分析显示,多达61个位点氨基酸具有较高的保守性。进化树分析结果显示,葡萄SBP-box基因共分为3个亚组。染色体定位分析显示,VvSBP基因在1号染色体上分布最多(4个),其次是染色体5、15、4、7、8、10、11、12、14、17、18和19,染色体2、3、6、9、13和16则没有分布。启动子作用元件分析表明,SBP-box家族所有成员的启动子均含有与果实发育和成熟相关的作用元件。结合RT-qPCR结果,发现约9个成员可能促进了葡萄果实的成熟过程,且大部分成员属于第1亚组和第3亚组;约7个成员可能促进了葡萄果实的生长发育,但抑制了果实的转色与成熟过程,且大部分成员属于第2亚组。[结论]葡萄SBP-box基因结构高度保守,多数成员参与调控果实发育与成熟过程。