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杜仲BR受体蛋白基因EuBRI1克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘明月 1 ; 赵懿琛 2 ; 赵德刚 3 ;

作者机构： 1.贵州大学农业生物工程研究院生命科学学院山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室

2.贵州大学茶学院

3.贵州省农业科学院

关键词： 杜仲;EuBRI1;基因克隆;生物信息学分析

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2018 年 04 期

页码： 1582-1588

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为解析杜仲BR相关基因功能,本研究通过前期构建的杜仲转录组数据库注释的信息,获得BRI1同源序列。设计特异性引物,以杜仲基因组DNA及c DNA为模板进行PCR扩增克隆得到3 612 bp cDNA序列,命名为EuBRI1。序列分析发现EuBRI1是一个无内含子的完整开放阅读框,编码1 203个氨基酸的蛋白。分析表明,EuBRI1为稳定亲水性蛋白,相对分子质量为131.361 kD;理论等电点p I为6.31;对其二级结构分析显示α-螺旋占31.50%,无规卷曲占55.94%,延伸链占12.55%,EuBRI1含信号肽序列和跨膜结构以及BRI1家族激酶的保守结构域。进化树分析表明,EuBRI1蛋白序列与醋栗番茄(Solanum pimpinellifolium)BRI1进化上较接近,与橡胶树(Hevea brasiliensis)BRI1相对等较远。研究结果为进一步阐明杜仲BR相关基因的功能奠定基础。

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