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竹荚鱼属鱼类线粒体DNA控制区结构及其系统发育分析

文献类型： 中文期刊

作者： 苏天凤 1 ; 江世贵 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院南海水产研究所

关键词： 竹煲鱼属;线粒体DNA控制区;结构;系统发育

期刊名称： 南方水产科学

ISSN： 2095-0780

年卷期： 2011 年 001 期

页码：

收录情况： 北大核心

摘要： 采用PCR产物直接测序法测定了2尾来自中国南海的日本竹煲鱼(Trachurus japonicus)线粒体DNA控制区基因全序列,并结合从GenBank中下载的8种竹笑鱼属相应序列,对竹煲鱼属控制区序列进行了结构分析,识别出终止序列区、中央区和保守序列区3个区域,并找到了2个与DNA复制终止相关的序列TAS和中央保守区的保守序列CSB-F、CSB-E和CSB-D,以及保守序列区的保守序列CSBl、CSB2和CSB3.以鳜(Sinipercachuatsi)作为外群,使用邻接法和最大简约法构建了9种竹荚鱼属的系统发育树.竹笑鱼属鱼类为单系类群,蓝竹煲鱼(rpicturatus)、智利竹笑鱼(zmurphyi)、太平洋竹笑鱼(zsymmetricus)、南非竹荚鱼(rcapensis)和竹荚鱼(rtrachurus)构成一支,地中海竹笑鱼(zmediterraneus)、青背竹笑鱼(zdeclivis)、日本竹荚鱼(rjaponicus)和新西兰竹荚鱼(rnovaezelandiae)为另一支;日本竹笑鱼未单独成一支,而是聚人青背竹笑鱼和新西兰竹笑鱼之间,初步猜测日本竹笑鱼和新西兰竹荚鱼为同种异名.

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