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1型鸭疫里默氏杆菌铁依赖抑制子RaDtxR全长基因的扩增及生物信息学分析

文献类型: 会议论文

第一作者: 袁建丰

作者: 袁建丰 1 ; 覃宗华 1 ; 吕敏娜 1 ; 李林林 1 ; 孙敏华 1 ; 董嘉丈 1 ; 胡奇林 2 ;

作者机构: 1.广东省农业科学院兽医研究所 广东省兽医公共卫生公共实验室,广州 510640

2.广东省农业科学院兽医研究所 广东

关键词: 1型鸭疫里默氏杆菌;铁依赖抑制子;生物信息学分析

会议名称: 中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第一次全国鸭病防控高级研讨会

主办单位: 中国畜牧兽医学会

页码: 132-141

摘要: 为了扩增I型鸭疫里默氏杆荫铁依赖抑制子基因(RaDtxR)全长基因序列,对SiteFing—PCR技术做了进一步改良。改良后的siteFinding—PCR技术更加简单、方便且省时。SiteFinding—PCR结果显示获得的目的片段大小为937bp,向前延伸了710bp。RaDtxR全长基因序列为654个核苷酸,编码217个氨基酸。生物信息学表明RaPtxR包含完整的铁离子依赖抑制子超家族保守结构域,在进化分类上更接近于白喉棒状杆菌毒素抑制子DtxR。同源建模表明RaDtxR氨基酸序列含有典型的FUR/DtxR抑制子的HTH结构。

分类号: S858.32

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