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军曹鱼MHC-Ⅱβ基因全长cDNA的克隆与组织表达分析

文献类型： 会议论文

第一作者： 茅莉娜

作者： 茅莉娜 1 ; 冯娟 2 ; 郭志勋 2 ; 许海东 2 ; 李玉谷 3 ;

作者机构： 1.华南农业大学兽医学院,广州,510642 中国水产科学研究院南海水产研究所,广州,510300

2.中国水产科学研究院南海水产研究所,广州,510300

3.华南农业大学兽医学院,广州,510642

关键词： 军曹鱼;MHC-Ⅱβ基因;全长cDNA序列;基因克隆;组织表达

会议名称： 中国畜牧兽医学会动物解剖学及组织胚胎学分会第十六次学术研讨会

主办单位： 中国畜牧兽医学会

页码： 543-552

摘要： 采用同源克隆和末端快速扩增(RACE)的方法，得到1161bp的军曹鱼(Rachycentron canadum)MHC-Ⅱβ全长cDNA片段。该序列包括20bp的5’末端非编码区(UTR)，394bp的3’UTR及747bp的开放阅读框(ORF)，编码248个氨基酸，预测其蛋白质分子量约为27.99ku，等电点为6.21。通过构建MHC-Ⅱβ氨基酸序列的系统进化树，并进行氨基酸相似性比对，结果表明，军曹鱼和已知鱼类、鼠(Musmusculus)、鸡(Gallus gallus)及人类(Homo sapiens)MHC-Ⅱβ氨基酸的同源性在28.5％-77.5％之间。所推测的蛋白序列具有一些重要的特征，包括：前导肽、B1、B2和CP／TM／CYT区，保守的半胱氨酸等。Real-time PCR检测结果显示，MHC-Ⅱβ基因在正常军曹鱼组织中均表达，但表达量在各个组织中不同，其中，头肾表达较强，鳃、脾、肠表达程度中等，在心、脑、肌肉中表达较弱。

分类号： S917.4

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