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1型鸭疫里默氏杆菌铁依赖抑制子RaDtxR全长基因的扩增及生物信息学分析

文献类型： 会议论文

第一作者： 袁建丰

作者： 袁建丰 1 ; 覃宗华 1 ; 蔡建平 1 ; 谢明权 1 ;

作者机构： 1.广东省农业科学院兽医研究所 广东省兽医公共卫生公共实验室,广州 510640

关键词： 鸭疫里默氏杆菌;铁依赖抑制子;位点搜寻;聚合酶链式反应;生物信息学分析

会议名称： 第二届全国禽病分子生物技术青年学者论坛

主办单位： 中国畜牧兽医学会禽病学分会

页码： 88-96

摘要： 为了扩增1型鸭疫里默氏杆菌铁依赖抑制子基因(RaDtxR)全长基因序列，对SiteFing-PCR技术做了进一步改良。改良后的SiteFinding-PCR技术更加简单、方便且省时。SiteFinding-PCR结果显示获得的目的片段大小为937bp，向前延伸了710bp。RaDtxR全长基因序列为654个核苷酸，编码217个氨基酸。生物信息学表明RaDtxR包含完整的铁离子依赖抑制子超家族保守结构域,在进化分类上更接近于白喉棒状杆菌毒素抑制子DtxR。同源建模表明RaDtxR氨基酸序列含有典型的FUR/DtxR抑制子的HTH结构。

分类号： S858.32:S852.65

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