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猪传染性胃肠炎病毒福建株M基因的克隆与生物信息学分析

文献类型: 会议论文

第一作者: 朱晓琳

作者: 朱晓琳 1 ; 王劭 2 ; 陈少莺 2 ; 林锋强 3 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所 福建农林大学动物科学学院,福建,福州,350002

2.福建省农业科学院畜牧兽医研究所 福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心,福州,350013 福建农林大学动物科学学院,福建,福州,350002

3.福建省农业科学院畜牧兽医研究所 福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心,福州,350013 福建农林大学动物科学学院,福建,福州,35000

关键词: 猪;传染性胃肠炎病毒;基因克隆;生物信息学

会议名称: 福建省第六届猪病学术研讨会

主办单位: 福建省畜牧兽医学会

页码: 29-34

摘要: 本研究对猪传染性胃肠炎病毒(porcine transmissible gastroenteritis virus,TGEV)福建分离株(17GEV—FT株)M基因进行克隆、测序并利用生物信息学技术分析TGEV—FJ株M蛋白基因的同源性、信号肽、糖基化位点、磷酸化位点及其二级结构。结果显示,成功扩增出M基因完整目的片段(789bp),编码262个氨基酸,构建了M基因的克隆重组质粒pGEM—T—M。序列分析与遗传进化树显示,TGEV M基因属高度保守的基因,TGEV-FJ株与HN2002株亲缘较近。TGEV-FJ株M蛋白具有一个潜在信号肽剪切位点(ACG16—17ER),存在3个潜在的N-糖基化位点,丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸磷酸化位点分别有6个、1个和5个;TGEV-FJ株M蛋白二级结构α-螺旋区域占11.59%,β折叠区域占44.93%,无规则卷曲区域占43.48%。本研究结果为TGEV-FJ株M蛋白原核表达提供依据,并为TGEV分子诊断试剂及基因工程疫苗研究奠定基础。

分类号: S858.28:S852.65

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