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南瓜属EST-SSR标记的开发及在杂种纯度鉴定中的应用

文献类型： 会议论文

第一作者： Zhang Guo-yu

作者： Zhang Guo-yu 1 ; 张国裕 2 ; Zhang Fan 1 ; 张帆 2 ; Jiang Li-gang 3 ;

作者机构： 1.National Engineering Research Center for Vegetables,Beijing 100097,China

2.国家蔬菜工程技术研究中心,北京100097

3.National Engineering Research Center for Vegetables,Beijing

关键词： 南瓜;分子标记;杂种纯度;鉴定试验

会议名称： 中国园艺学会南瓜分会籽用南瓜新品种展示及产业发展研讨会

主办单位： 中国园艺学会

页码： 65-72

摘要： 为利用SSR标记进行快速、准确的南瓜杂交种纯度分析,本研究进行了南瓜EST-SSR标记的开发.从NCBI数据库下载1457条南瓜属作物EST序列,去除冗余序列后进行SSR位点搜索,共得到215条含有SSR位点的EST序列.这些SSR位点包含111种重复基元,其中二核苷酸(62个,占28.84％)和三核苷酸(86个,占40.0％)重复类型占主导地位；重复基元中出现最多的是CT(21个,占9.77％),其次为TC(13个,占6.05％)和AAG(12个,占5.58％).将215个SSR位点设计成EST-SSR引物后,随机合成了其中的43对引物.利用4份遗传背景差异较大的南瓜自交系对合成的43对引物进行扩增效果评价,其中28对引物有稳定清晰的扩增产物,占合成引物的65.12％.利用这些有效扩增引物对南瓜属作物商品杂交种进行纯度检测,共获得13个杂交组合的特异性检测引物,F1杂交种的纯度在79.2％～100.0％,与田问检测结果相符.以上结果表明,利用南瓜EST序列开发SSR引物具有简单快速、成本低和适用性好的特点.

分类号： S642.1:S603.7

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