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栉江珧微卫星标记开发与筛选研究

文献类型： 会议论文

第一作者： 白临建

作者： 白临建 1 ; 杨爱国 2 ; 周丽青 1 ; 吴彪 1 ; 刘志鸿 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业部海洋渔业可持续发展重点实验室,山东青岛 266071

2.上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306

关键词： 栉江珧;微卫星标记;多态位点;基因筛选

会议名称： 2011年全国海水养殖学术研讨会

主办单位： 中国水产学会

页码： 210-219

摘要： 栉江珧是广泛分布于温、热带近海海域的大型深水双壳贝类，隶属于软体动物门、瓣腮纲、翼形亚纲、贻贝目、江珧科，江珧属，经济价值很高。贝类的酶切位点往往具有较高的突变率，这将导致无效等位基因频率大大提高，从而出现根据一个个体的微卫星序列设计的引物可能无法在其他个体中扩增出条带的现象。由此，贝类多态位点的筛选效率相对较低，多态性引物的获得往往需要设计大量引物进行筛选。微卫星的多态性体现在微卫星核心序列重复次数的增减，即微卫星长度的变化，微卫星核心序列的突变率相对较高，达10-5-10-3，是微卫星高多态性的基础。多数学者认为微卫星的多态性与核心序列的重复数具正相关性，即重复数越多的位点多态性也越高；Weber认为微卫星核心序列的重复数只有到达一定程度时才能体现出多态性，而且重复次数高的微卫星位点能在种间、种内两个水平产生多态性，重复次数低的微卫星位点仅在种间产生多态性；重复次数低于5的微卫星位点一般无法检测出多态性。本研究通过磁珠的洗涤，将核心序列重复数较短的、与探针连接不牢固的微卫星序列洗走，得到的微卫星序列均具有较高的重复数，为多态性微卫星位点的高筛出率奠定了基础。

分类号： Q959.215.03

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