文献类型: 会议论文
第一作者: LI Xiao-bai
作者: LI Xiao-bai 1 ; 李小白 2 ; XIANG Lin 1 ; 向林 2 ; TIAN Sheng-ping 1 ; 田胜平 2 ; WU Chao 3 ;
作者机构: 1.Zhejiang Academy of Agricultural Sciences , Hangzhou 310021
2.浙江省农业科学院,杭州310021
3.Zhejiang Academy
关键词: 建兰;转录组;基因测序;基因组注释
会议名称: 中国园艺学会观赏园艺专业委员会2013年学术年会
主办单位: 中国园艺学会
页码: 00000156-00000162
摘要: 目前对兰属植物的分子生物学研究十分有限,其相关的基因序列也非常之少.为了研究挖掘花发育或者开花的相关基因,这里提取了建兰花苞和成花的RNA对其进行了测序,取得了9.52Gb去杂的数据,包含了98819349条reads.其中101423条isogenes序列,代表了51696个基因,含139385689个碱基对.对这些序列进行了功能注释分析,14612条isogenes有23类COG分类注释,41873条isogenes有58类GO注释,另外17542条isogenes含有292类KEGG途径注释,且发现了158和119个分别与花器官发育和开花相关的基因.这些信息为研究兰属的花发育以及开花机理的研究奠定了基础.
分类号: S682.31:S601
- 相关文献
[1]稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构与多样性分析. 刘小改,杨亚军,廖秋菊,徐红星,刘映红,吕仲贤. 2016
[2]建兰花发育相关B、C和E类MADS-box基因的表达分析. 向林,陈跃,陈丽萍,孙崇波. 2018
[3]建兰转录本的微卫星序列和单核苷酸多态性信息分析. 李小白,向林,罗洁,秦德辉,孙崇波. 2014
[4]利用建兰转录数据开发genic-SSR标记. 李小白,金凤,金亮,马广莹. 2014
[5]建兰基因内部SSR标记的初步开发. LI Xiao-bai,李小白,JIN Feng,金凤,XIANG Lin,向林,QIN De-hui. 2014
[6]建兰唇瓣和侧内瓣的比较蛋白组学分析. LI Xiao-bai,李小白,JIN Feng,金凤,JIN Liang. 2015
[7]转录组测序(RNA-seq)策略及其数据在分子标记开发上的应用. 李小白,向林,罗洁,胡标林,田胜平,谢鸣,孙崇波. 2013
[8]洋桔梗(Eustoma grandiflorum)干旱胁迫转录组初步分析. 安霞,朱强,楼旭平,李鲁峰,陈杰,柳婷婷,李文略,骆霞虹,朱关林,余利隽. 2022
[9]黄麻(Corchorus capsularis L.)干旱胁迫转录组初步分析. 金关荣,陈杰,安霞. 2020
[10]鸭不同羽色毛囊组织差异表达基因转录组测序分析. 蒋兵兵,黄曼曼,白天,曾涛,陈黎,沈军达,陶争荣,周玮,刘国发,卢立志,李海英. 2020
[11]有翅型和无翅型小麦禾谷缢管蚜转录组差异分析. 鲁艳辉,虞飞博,郭嘉雯,田俊策,郑许松,吕仲贤. 2021
[12]转录组分析揭示热激诱导家蚕孤雌生殖发生相关的信号通路. 陈金娥,杜鑫,徐霞,于少芳,姚陆松,何秀玲,王永强. 2022
[13]基于RNA-seq的能源植物芒转录组分析. 张贤,王建红,喻曼,曹凯,庄俐,徐昌旭,曹卫东. 2015
[14]OsDCL1基因沉默突变体诱导稻瘟病抗性的转录组分析. 张丹丹,吴殿星,周波. 2016
[15]多头菊头状花序转录组SSR特点分析. 吴超,郭方其,徐丹彬,付曼曼,丁晓瑜,黎侠,周勤. 2022
[16]低温胁迫下枇杷不同发育阶段的花果转录组比较分析. 徐红霞,周慧芬,李晓颖,姜路花,陈俊伟. 2021
[17]茭白'浙农7号'不同生长阶段的叶片转录组学及激素水平分析. 张珏锋,李芳,钟海英,陈建明. 2024
[18]模拟干旱胁迫下大豆耐旱突变体的生理和转录组分析. 曹颖,竹龙鸣,邓平,陈紫芸,袁凤杰. 2024
[19]褪黑素预处理对桃耐涝性的调控效应. 古咸彬,陆玲鸿,宋根华,肖金平,张慧琴. 2022
[20]不同腹脂率番鸭回肠转录组差异分析. 王小骊,王兴鑫,杨彩梅,肖英平,杨华,吕文涛. 2022
作者其他论文 更多>>
-
不同品种草莓花器与花粉特征变异及SSR遗传多样性研究
作者:忻雅;余霞奎;李小白;余红
关键词:草莓;花器;花粉;SSR标记;主成分分析
-
生姜提取物试纸对鲜食无花果的保鲜作用
作者:刘莉;徐伟韦;钱继昌;金亮;李小白
关键词:生姜提取物;无花果;保鲜
-
中药材白及分子鉴定研究进展
作者:金亮;郭方其;付曼曼;吴超;李小白
关键词:白及(Bletilla striata);混伪品;分子鉴定;分子标记;DNA条形码
-
蓝莓无糖组培关键技术因素研究
作者:陈相涛;陈芳芳;王方;郇伟伟;李洁;李小白
关键词:蓝莓;无糖组培;植物生长调节剂;固液比;抑菌剂
-
鲜食掌叶覆盆子种植技术
作者:金亮;李小白;江景勇;陈珍;曹群阳;赵张建
关键词:掌叶覆盆子;Rubus chingii Hu;鲜食;种植技术
-
基于GBS测序的不同来源菊花种质遗传结构分析
作者:付曼曼;叶琪明;吴超;董彬;方丽;李小白;丁晓瑜;陈炜;陈天烺;郭方其
关键词:菊花;GBS;SNP;群体遗传结构;系统进化
-
掌叶覆盆子染色体计数及基因组大小测定
作者:金亮;李春楠;詹书侠;李小白;华金渭
关键词:掌叶覆盆子;染色体数目;基因组大小;流式细胞术;K-mer分析