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建兰转录组的测序与分析

文献类型: 会议论文

第一作者: LI Xiao-bai

作者: LI Xiao-bai 1 ; 李小白 2 ; XIANG Lin 1 ; 向林 2 ; TIAN Sheng-ping 1 ; 田胜平 2 ; WU Chao 3 ;

作者机构: 1.Zhejiang Academy of Agricultural Sciences , Hangzhou 310021

2.浙江省农业科学院,杭州310021

3.Zhejiang Academy

关键词: 建兰;转录组;基因测序;基因组注释

会议名称: 中国园艺学会观赏园艺专业委员会2013年学术年会

主办单位: 中国园艺学会

页码: 00000156-00000162

摘要: 目前对兰属植物的分子生物学研究十分有限,其相关的基因序列也非常之少.为了研究挖掘花发育或者开花的相关基因,这里提取了建兰花苞和成花的RNA对其进行了测序,取得了9.52Gb去杂的数据,包含了98819349条reads.其中101423条isogenes序列,代表了51696个基因,含139385689个碱基对.对这些序列进行了功能注释分析,14612条isogenes有23类COG分类注释,41873条isogenes有58类GO注释,另外17542条isogenes含有292类KEGG途径注释,且发现了158和119个分别与花器官发育和开花相关的基因.这些信息为研究兰属的花发育以及开花机理的研究奠定了基础.

分类号: S682.31:S601

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