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甘薯褪绿矮化病毒西非株系的实时荧光定量PCR检测方法及应用

专利类型: 中国发明申请

专利权人: 河南省农业科学院植物保护研究所

发明人: 张振臣;王丽;张德胜;王爽;乔奇;秦艳红;田雨婷;王永江

专利号: CN201410121827.8

摘要: 本发明涉及一种甘薯褪绿矮化病毒西非株系实时荧光定量PCR检测方法及应用,该方法以甘薯褪绿矮化病毒西非株系SPCSV-WA的核苷酸序列为模板,设计扩增SPCSV-WA cp基因的特异性引物和特异性CSV探针,提取感病甘薯叶片的总RNA;用CSV-DL2引物反转录合成cDNA第一链,然后用CSV-CP-P2引物反转录合成cDNA第二链,利用CSV-CP-P1和反向引物CSV-CP-P2进行PCR扩增反应;以SPCSV-WA cp基因的重组质粒为阳性标准质粒绘制标准曲线,通过优化反应体系和反应条件,建立了SPCSV-WA的实时荧光定量PCR检测方法。结果表明,该方法只能检测到目的病毒,标准曲线的斜率和相关系数分别为-3.239和1,扩增效率为103.568%;最低可检测到约3.31拷贝/µL的阳性质粒,灵敏度比常规PCR高1000倍。本发明实时荧光定量PCR方法可用于田间甘薯样品的检测,为SPCSV的早期预警和流行学研究提供了技术手段。

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