科研产出
闽江河口湿地植物根际土壤氨氧化细菌群落结构分析
《福建农业学报 》 2020 CSCD
摘要：[目的]研究闽江河口湿地不同植物根际土壤中氨氧化细菌群落多样性及结构组成,为阐明湿地植物根际土壤脱氮功能微生物类群研究提供科学数据.[方法]多点混合采样法采集不同季节不同土层闽江河口湿地芦苇、互花米草和红树林根际的土壤样品共24个,通过高通量测序技术测定样品氨单加氧酶编码基因amoA序列,生物信息学方法分析土壤样品氨氧化细菌的群落结构及多样性.[结果]24个样品中共检测到300527条有效序列,2794个OTU.多样性分析结果表明,芦苇、互花米草和红树林根际土壤样品Chao指数差别不大,Shannon指数平均值表现为红树林>芦苇>互花米草;芦苇和红树林根际土壤样品Chao指数和Shannon指数均表现为春季最低;不同土层芦苇、互花米草和红树林根际土壤样品Chao指数和Shannon指数均未呈现出明显的变化趋势.群落结构分析结果表明,闽江河口湿地土壤样品中存在着较多分类地位未确定的氨氧化细菌,而分类地位确定的氨氧化细菌中,优势菌门为变形菌门(Proteobacteria),优势菌属包括亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)、硫杆菌属(Thiobacillus)、Caldimonas属等.[结论]闽江河口湿地植物根际土壤中氨氧化细菌的主要优势菌群大多是亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas),硫杆菌属(Thiobacillus)和Caldimonas属为个别样品的优势菌群.
关键词： 闽江河口湿地 氨氧化细菌 amoA基因 群落结构 高通量测序技术
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山羊地方性鼻内肿瘤病毒ENTV/CH/GT/2015株全基因组cDNA文库的构建及生物信息学分析
《中国兽医学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为获得山羊地方性鼻内肿瘤病毒(ENTV-2)古田株(暂命名为:ENTV/CH/GT/2015株)全基因组序列.通过PCR方法从山羊鼻内肿瘤组织中分段扩增获得ENTV-2全基因组7个片段,目的片段经胶回收后分别连接至pMD19-T载体上,并转化至基因工程菌DH5a,提取阳性质粒进行测序,利用生物学软件对获得的序列进行拼接分析.获得ENTV/CH/GT/2015株全基因组序列长度为7 506 bp,包含相互重叠的gag-pro-pol-env编码区及5′端非编码区,并上传至GenBank上获得登录号为MK210250.1;与国外NC004994.2株和AY197548.2株核苷酸同源性均为87.5%,与国内ENTV-2CHN8株核苷酸同源性为97.7%.氨基酸序列分析结果显示,gag蛋白在124~126 aa插入GVE 3个氨基酸和229~232 aa插入APPP 4个氨基酸,env蛋白在590~593 aa处存在AESL 4个氨基酸的缺失;gag和env蛋白抗原表位分析结果显示,尽管存在氨基酸的突变和缺失,但抗原表位并没有明显差异.糖基化位点预测结果显示:gag、pro、pol和env蛋白分别含有1,1,4,6个糖基化位点,均可能不包含信号肽.遗传进化树分析结果推测,该毒株是国内ENTV-2CHN2株和ENTV-2CHN10株变异毒株.本研究获得ENTV/CH/GT/2015株全基因序列并明确其生物学特性,不仅丰富了ENTV-2全基因序列库,还为今后研究ENTV-2快速检测方法及致病机理提供了研究素材.
关键词： 山羊 地方性鼻内肿瘤病毒 全基因克隆 生物信息学分析
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柚芽变株系类胡萝卜素代谢差异基因的转录组学分析
《热带作物学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为了研究'琯溪蜜柚'果实红肉突变株系类胡萝卜素代谢和芽变的分子机制,本研究以'琯溪蜜柚'及其芽变一代品种'红肉蜜柚'和芽变二代品种'三红蜜柚'果实为材料,使用RNA-seq技术研究3个品种3个发育时期果肉类胡萝卜素的代谢.经生物信息学分析,共筛选出参与类胡萝卜素生物合成显著差异表达的10个基因,分别为八氢番茄红素合成酶基因(PSY)、六氢番茄红素脱氢酶基因(ZDS)、类胡萝卜素异构酶基因(CRTISO1、CRTISO2)、紫黄质脱环氧酶基因(NPQ1)、9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶基因(NCED3、NCED5)、脱落醛氧化酶基因(AAO3)、ABA 8'-羟化酶基因(CYP707A1)、类胡萝卜素裂解双加氧酶基因(CCD4).共表达分析揭示了7个家族转录因子的表达模式与类胡萝卜素合成基因高度相关,分别为MADS、bZIP、bHLH、MYB、AP2/ERF、NAC和WRKY.通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证了部分基因的表达模式,结果与RNA-seq结果高度一致.此外,经对'红肉蜜柚'果肉转色期的初生和次生代谢通路DEGs富集分析,发现类胡萝卜素的积累过程中,细胞壁、脂质、类黄酮代谢差异基因大量富集.研究结果揭示,'琯溪蜜柚'果实红肉突变品种'红肉蜜柚'和'三红蜜柚'果实类胡萝卜素的形成和积累,是由类胡萝卜素的代谢相关酶基因差异表达和转录因子调控引起的;在果肉红色芽变的同时,伴随着与汁胞粒化相关的基因突变.这对进一步开展柚子果实类胡萝卜素的形成与积累、汁胞粒化研究,为解析柚果实不同颜色突变、汁胞粒化的机制有重要参考价值.
关键词： 琯溪蜜柚 芽变 类胡萝卜素 转录组 基因 转录因子
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太子参根腐病病原菌的鉴定及防治药剂筛选
《植物保护学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为有效防控太子参根腐病,本研究于2017年3月—2019年6月自福建省宁德市柘荣县太子参主产区采集具有典型根腐病症状的植株和块根病样,分离纯化获得病原菌,利用形态学特征、分子生物学特性及致病性测定对其进行鉴定;同时通过测定平板抑制率和扫描电镜观察分析6种杀菌剂对太子参根腐病病原菌菌丝生长的抑制效果。结果表明:太子参根腐病典型症状为苗期和生长期植株萎蔫、根部和茎基部褐变;块根表皮呈现开裂、组织褐变和干腐状。分离纯化后获得22株培养性状一致的菌株,结合菌株的形态学特征、EF-1α基因序列和特异性引物FOF1/FOR1检测,将该病原菌鉴定为尖孢镰刀菌Fusarium oxysporum。致病性测定结果表明其发病症状与田间表现一致,且符合科赫氏法则。经筛选6.6%嘧菌酯·1.1%咯菌腈·3.3%精甲霜灵悬浮种衣剂和25%吡唑醚菌酯乳油对该病原菌有良好的抑制效果,稀释至2 000倍液的抑制率分别为78.52%和75.36%;扫描电镜观察显示这2种杀菌剂处理组的菌丝体发育畸形、断裂、表面皱缩或消解,未见产孢细胞;而无菌水对照处理组的菌丝体生长正常,可见产孢细胞。表明筛选到的2种杀菌剂可用于防治由尖孢镰刀菌引起的太子参根腐病。
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福建省草地贪夜蛾种群的耐寒性与越冬能力研究
《应用昆虫学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：【目的】明确草地贪夜蛾Spodopterafrugiperda的耐寒性与越冬能力,进而分析其在福建省的越冬区和周年发生区。【方法】应用校正死亡率分析草地贪夜蛾在低温下的存活能力,利用机率值分析法计算草地贪夜蛾的LT50、LT90和LT99并评价其耐寒性;采用模拟越冬、田间挖蛹、成虫性诱及受害率调查观测法,结合气象资料分析草地贪夜蛾的越冬能力和周年发生区。【结果】低温对草地贪夜蛾具有明显的致死作用,在0、4和8℃下,试虫的死亡率随着温度的降低和处理时间的延长而上升,其致死时间（LT50、LT90和LT99）随之缩短。不同发育阶段的草地贪夜蛾在不同低温下的存活能力具有很大的差异。该虫的耐寒性以卵为最弱,蛹最强;1-3龄幼虫的耐寒性大于4-6龄的;雌成虫比雄成虫的耐寒性强。草地贪夜蛾卵在福州闽侯和晋安1-3月期间不能存活;在福州闽侯、三明大田和南平建瓯无冬玉米种植区的草地贪夜蛾越冬蛹中,一部分能在越冬过程中陆续羽化,但冬季羽化的成虫由于低温或缺乏适宜寄主植物不能繁殖,另一部分则逐渐死亡;而在福州晋安,有2.08%的蛹能存活越过3月15日从而完成越冬。在莆田仙游和漳州长泰2个冬玉米种植区,草地贪夜蛾低龄幼虫、蛹和成虫均可在全年最冷月的1、2月份发生。【结论】在草地贪夜蛾各虫态中,卵的耐寒性最弱,蛹的最强,在无冬玉米种植区,蛹是最有可能的越冬虫态。1-3月期间的环境温度决定草地贪夜蛾的越冬能力和周年发生区分布。在1-3月期间日均温≤12.6℃的地区,蛹不能完成整个越冬过程,其在≥14.2℃的地区可以完成越冬。草地贪夜蛾在1-3月期间日均温≥15.0℃的冬玉米种植区可以周年发生为害,低龄幼虫、蛹和成虫可能是其在冬玉米种植区的越冬虫态。
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乌龙茶品种鲜叶加工白茶过程中香气成分动态变化规律
《茶叶科学 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：乌龙茶品种茶树鲜叶加工白茶具有明显的花香特征.为探明该原料在白茶加工过程中香气成分的形成与变化规律,在室内控温控湿(温度18~22℃,湿度45%~60%)环境条件下,选用福鼎大毫茶、福安大白茶和福云6号制成的传统白茶为对照,采用顶空固相微萃取法-气质联用法对茗科1号等10个适制乌龙茶品种鲜叶的萎凋在制品及其成品茶(简称花香白茶)进行了香气成分检测和化学计量分析.结果表明,花香白茶与传统白茶存在迥然不同的香气组成化学模式.各乌龙茶品种鲜叶加工的花香白茶及其在制品的香气组成化学模式具有较高相似度;随着鲜叶萎凋减重率的增加,其香气组成在主成分分析二维得分视图中的模式分布渐趋离散,并发生群体定向逐步偏移.聚类分析结果显示,花香白茶在加工过程中香气组成的动态变化与采制原料的品种特性密切相关.鲜叶萎凋减重率30%~60%为影响花香白茶香气品质形成的关键发展阶段,并以萎凋后期(减重率≥45%)对其在制品香气组成的影响最为突出.从乌龙茶品种试样中可检出的136种香气成分显著富集于3种变化趋势模型,其中芳樟醇及其氧化物、香叶醇、橙花醛、水杨酸甲酯、β-紫罗酮、二氢猕猴桃内酯等香气成分可视为花香白茶香气品质工艺耦合调控的主要化学评测指标.
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苦瓜枯萎病原菌的绿色荧光蛋白基因标记
《福建农业学报 》 2020 CSCD
摘要：[目的]苦瓜枯萎病是由尖孢镰刀菌苦瓜专化型(Fusarium oxysporumf.sp.momodicae)侵染引起的一种重要土传病害.为有效防控该病害,对其病原菌进行绿色荧光蛋白基因(gfp)标记,为研究病原菌在苦瓜植株体内的侵染特性提供可视化跟踪检测手段.[方法]采用农杆菌介导的遗传转化方法对苦瓜枯萎病原菌强致病性野生型菌株FJAT-3018进行绿色荧光蛋白基因(gfp)标记,通过对转化子的菌落形态观察、生长速率和致病性测定,筛选出遗传稳定的转化子.[结果]野生型菌株FJAT-3018的转化效率约为14.5个转化子/106个孢子.经10次继代培养,筛选获得的转化子在菌落形态、生长速率和致病性方面与野生型菌株FJAT-3018无明显差异,gfp基因在转化子的菌丝体和分生孢子中均能强表达;通过激光共聚焦显微镜扫描跟踪发现,转化子能够在苦瓜植株根部和茎部侵染与定殖.[结论]绿色荧光蛋白基因已成功转入到苦瓜野生型菌株FJAT-3018中,其转化子具有良好的遗传稳定性且致病力不受影响.
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饲粮中不同青贮笋壳替代比例对肉羊消化代谢的影响
《动物营养学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为了提高青贮笋壳在肉羊中的利用效率,本研究测定分析了青贮笋壳的常规营养成分,并开展了其在湖羊、努比亚山羊和福清山羊3个肉羊品种上的体内消化代谢试验.试验采用两因素3*4随机区组设计,3个品种肉羊(湖羊、努比亚山羊和福清山羊)分别选取体况良好的7月龄左右生长期羯羊12只,体重分别为(22.18±1.13) kg、(30.32±1.17) kg和(17.09±0.91) kg;将每个品种的12只肉羊随机分为4个处理,分别饲喂基础饲粮(AC)以及以20%(A20)、40%(A40)或60%(A60)青贮笋壳替代基础饲粮的试验饲粮,每个处理3个重复,每个重复1只羊.全收粪、尿法测定饲粮中干物质(DM)、有机物(OM)、粗蛋白质(CP)、总能(GE)、中性洗涤纤维(NDF)和酸性洗涤纤维(ADF)的全肠道表观消化率,分析不同青贮笋壳替代比例对3个品种肉羊氮代谢和能量代谢的影响,并根据替代法原理计算不同青贮笋壳替代比例饲粮中青贮笋壳相应营养物质的全肠道表观消化率和有效能值.结果表明:1)青贮笋壳(DM基础)的GE、CP、粗脂肪(EE)、NDF、ADF、酸性洗涤木质素(ADL)、粗灰分(Ash)、钙(Ca)和磷(P)含量分别为16.99 MJ/kg、9.89%、11.00 g/kg、64.07%、36.01%、5.44%、6.10%、12.30 mg/kg和0.14%,在不同品种肉羊中的消化能(DE)和代谢能(ME)估测值分别为6.01~9.33 MJ/kg和4.93~7.65 MJ/kg.2)肉羊品种对饲粮中DM、OM、GE的全肠道表观消化率以及粪氮、沉积氮、氮沉积率和氮生物学价值具有极显著的影响(P<0.01),青贮笋壳替代比例对饲粮中DM、OM、CP、GE、NDF和ADF的全肠道表观消化率具有极显著的影响(P<0.01);随着饲粮中青贮笋壳替代比例的增加,湖羊对饲粮中蛋白质成分的消化利用以及努比亚山羊和福清山羊对饲粮中以NDF为主的能量物质和蛋白质成分的消化利用降低;青贮笋壳替代比例不超过40%的条件下,努比亚山羊对饲粮中的CP利用效率最优,其次为湖羊.3)肉羊品种、青贮笋壳替代比例及其交互作用对青贮笋壳中DM、OM、CP、GE、NDF和ADF的全肠道表观消化率和估测的DE和ME均无显著影响(P>0.05).综上所述,青贮笋壳具有CP含量较高、NDF含量适中、ADF和ADL含量低的特点,是肉羊营养价值较高的植物性非常规饲料资源;不同肉羊品种对青贮笋壳的利用率存在差异,在不同品种肉羊生产中利用时,需要优化饲粮配比,提高利用效率.
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