科研产出
黄皮转录组SSR挖掘及其可用性分析
《园艺学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要:利用MISA软件筛选黄皮(Clausena lansium)转录组测序获得的68 998条Unigene,共检测出单核苷酸至六核苷酸重复类型的SSR位点11 825个,分布于11 000条Unigene中,出现频率为17.14%,平均分布距离为4.41 kb。6种SSR位点类型中主要为单、二、三个核苷酸重复,分别占总SSR位点的41.48%、24.92%和27.53%。11 825个SSR位点中共发现207种重复基序,重复次数在4~24次之间,其中出现频率高的基序有A/T、AG/CT、AT/AT、AAG/CTT和AAT/ATT。位点序列长度分布在12~25 bp之间,其中12~15 bp最多,占50.95%(6 025个SSR位点)。通过Primer 3设计得到6 102对SSR引物,随机选择30对引物进行多态性验证分析,结果显示24对有效扩增引物中,13对引物在16份不同黄皮种质中表现出多态性。以上结果表明,黄皮转录组测序产生的Unigene信息可作为开发SSR标记的有效来源,开发的大批量SSR标记可为黄皮种质资源遗传多样性分析和遗传图谱构建提供更加丰富可靠的标记选择。
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长豇豆新品种‘宝佳豇豆’
《园艺学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要:‘宝佳豇豆’长豇豆是利用‘丰产6号’与‘丰产2号’杂交后代,经系谱法选育而成的中早熟新品种。豆荚绿白色,荚顺直,肉厚,长59 cm,宽1 cm,单荚质量28 g,荚形整齐,荚面微凸,纤维少,品质优,双荚率高。产量高,对光周期反应不敏感,田间表现抗枯萎病,抗逆性较强。适宜广东省春秋季种植。
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侵染广东辣椒的辣椒脉斑驳病毒的分子特征
《园艺学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要:辣椒脉斑驳病毒(Chilli veinal mottle virus,ChiVMV)是引起广东辣椒病毒病的主要病原之一,为了明确侵染为害广东辣椒的ChiVMV分子特征,采用分段RT-PCR和RACE扩增方法克隆了ChiVMV广东分离物(ChiVMV-GD)的基因组全序列,结果表明,除poly(A)尾外,ChiVMV-GD基因组大小为9 721 nt,编码一个大小350.44 kD多聚蛋白(位于167~9 436 nt),5′–非编码区(5′-UTR)和3′–非编码区(3′-UTR)分别含有166和285 nt,5′–末端结合病毒基因组连接蛋白(VPg),3′–末端含有poly(A)尾。序列同源性分析结果表明:Chi VMV-GD与Chi VMV其他分离物的基因组序列同源率为79.1%~96.9%,其中与来自中国海南分离物(登录号:GQ981316.1)的同源率最高(96.9%)。系统进化分析结果显示,ChiVMV-GD与海南分离物聚集在一个小分支,说明与海南分离物亲缘关系最近。
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冬瓜新品种“铁柱2号”
《农村百事通 》 2018
摘要:"铁柱2号"为优质、高产、耐储中熟杂交冬瓜新品种,2016年9月通过了广东省农作物品种审定委员会审定。该品种中熟,生长势强,茎蔓生,分枝性中强。瓜长圆柱形,瓜形一致,匀称,皮色墨绿,浅棱沟,平均瓜长82.4厘米、横径19厘米,肉厚6.6厘米。肉质致密,囊腔小,平均单瓜重14.8公斤,可
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白木香AsFPS1启动子的克隆及功能的初步分析
《基因组学与应用生物学 》 2018 北大核心 CSCD
摘要:本研究利用白木香(Aquilaria sinensis)同属植物Aquilaria agallocha的基因组数据,获得一条具有与白木香法呢基焦磷酸合酶基因(AsFPS1)相似性极高的基因序列,并克隆了该基因的起始密码子(ATG)上游1 226 bp处的启动子序列。该序列中AT含量为63.03%,与启动子特征相符。预测的转录起始位点位于起始密码子ATG上游73 bp处,除了具有CAAT-BOX和TATA-BOX等真核生物启动子核心元件外,还存在ARE,Box I,G-Box,ACE等厌氧诱导顺式作用元件和光应答元件。该序列能够驱动GUS的表达,具有启动子的活性,茉莉酸甲酯和赤霉素两种激素处理可显著地增强该启动子活性。本实验为进一步研究AsFPS1基因的表达及调控机制研究提供了一定的理论依据。
关键词: 白木香 法呢基焦磷酸合酶 启动子 瞬时表达 GUS
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近十年广东稻瘟病菌生理小种变化分析
《仲恺农业工程学院学报 》 2018
摘要:从2006-2015年近10年间收集的来自广东各地的7 225份穗颈瘟样本中分离出稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)单孢菌株3 690个,经接种到中国水稻稻瘟病菌鉴别品种上共鉴定出8群51个生理小种,其中以ZB群、ZC群和ZG群为主要优势种群,而ZB群出现频率最高,为48.44%~75.35%;病菌生理小种以ZB13、ZB15、ZC15、ZC13和ZG1为主要优势小种,其中ZB13出现频率最高,为32.47%.
关键词: 稻瘟病 稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae) 生理小种 变化动态
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缺铁应答基因FOX1上游调控基因的筛选
《生物技术 》 2018 北大核心
摘要:[目的]筛选与莱茵衣藻FOX1基因启动子结合的调控基因序列。[方法]利用酵母单杂交的方法,构建pHIS2.1-FOX1诱饵载体,并将其转入到酵母菌株Y187中,在SD/-Trp/-His/-Leu/50 mmol/L 3-AT筛选培养基上挑选酵母阳性转化子,PCR克隆阳性转化子的序列并测序,利用Blastx程序检索phytozome莱茵衣藻基因组数据库,获得阳性转化子序列的同源基因信息。[结果]18个酵母阳性转化子测序成功,其同源基因主要有CTR型铜离子转运体(CTR2)、核糖体蛋白,和参与光合作用、氧化还原反应和物质运输等方面的功能蛋白。[结论]利用酵母单杂交技术筛选到缺铁应答基因FOX1潜在的上游调控基因。
关键词: 酵母单杂交 莱茵衣藻 缺铁应答 FOX1基因 启动子 上游调控基因
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植物提取物的生物学功能及其在仔猪生产上的应用
《中国畜牧兽医 》 2018 北大核心
摘要:植物提取物(PE)是通过物理化学等方式从植物中得到的单一或混合物质,含有多酚、生物碱、多糖、精油等活性物质。其生物学功能多样:调控抗氧化酶活,降低过氧化物含量,抑制或清除自由基等;通过调控NF-κB、ERK、JNK活化及相关转录因子的表达,实现机体免疫应答;降低炎性因子及其相关基因表达,缓解炎症;具有抗菌作用,不容易产生耐药性;通过改变癌细胞细胞周期,实现细胞凋亡,达到抗癌目的;对疟原虫、丝虫、克氏锥虫等寄生虫有显著抑制作用。植物提取物在仔猪生产上应用广泛,具有良好的效果:能提高仔猪平均日增重(ADG)、饲料转化率等生长性能,如菠萝茎、八角提取物;促进仔猪消化吸收,提高营养物质代谢;降低血液转氨酶、碱性磷酸酶(AKP)活性,缓解应激;提高仔猪血液抗氧化酶活性,降低过氧化物水平;提高仔猪血液细胞因子、免疫球蛋白的含量,增强机体免疫功能;调控肠道菌群,改善肠道黏膜形态,减少仔猪腹泻。植物提取物是绿色健康的添加剂,其广泛普及可大幅度减少抗生素的使用。随着生物技术的发展,植物提取物在健康养殖中将发挥越来越大的作用。
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