科研产出
反相高效液相色谱法测定西番莲中的有机酸
《热带作物学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：采用Waters Atlantis C18色谱柱(150 mm×4.6 mm,5μm),以2%甲醇-98%0.01 mol/L K2HPO4溶液(用H3PO4调节p H2.8)作为流动相,流速为0.6 m L/min,柱温为30℃,进样量为10μL,检测波长为210 nm,建立高效液相色谱同时分析西番莲中10种有机酸的方法。结果表明:该方法相对标准偏差为0.22%~4.00%,平均回收率在88.0%~109.6%,各种酸的线性相关系数r>0.999 2,检测限为0.001~0.22μg/m L;采用外标法定量。在紫果和黄果西番莲中检测到7种有机酸,其含量趋势呈现为柠檬酸>L-苹果酸>L-乳酸>琥珀酸>L-抗坏血酸>酒石酸>富马酸。该方法具有灵敏度高、测试组分多、速度快等优点,适用于西番莲中多种有机酸的测定。
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香蕉和土壤中吡唑醚菌酯的残留分析
《热带作物学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：建立吡唑醚菌酯在香蕉全蕉、蕉肉及土壤中的残留分析方法,测定吡唑醚菌酯在云南、海南两地香蕉及土壤中的残留动态及最终残留。结果表明:在0.01~0.1 mg/kg添加范围内,吡唑醚菌酯在香蕉果、肉、土中的平均回收率为82%~104%,变异系数为1.3%~3.6%;方法最小检出量为1×10-10 g,最低检出浓度为0.01 mg/kg。吡唑醚菌酯在云南和海南两地香蕉中的半衰期分别为17.2、16.7 d,在土壤中的半衰期分别为19.9、17.9 d。施药后35、42、49 d收获的香蕉中吡唑醚菌酯残留量均低于0.02 mg/kg。该方法准确度高,灵敏度高,线性良好。
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海马齿Δ~1-吡咯啉-5-羧酸合成酶(SpP5CS)基因的克隆和表达分析
《植物生理学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：以海马齿为材料,根据已克隆的P5CS基因的保守序列设计简并引物,利用RT-PCR和RACE技术从海马齿中获得了一个海马齿Δ1-吡咯啉-5-羧酸合成酶基因。该基因cDNA序列全长2 452 bp,其中包括开放读码框为2 169 bp、5￠-UTR 52 bp和3￠-UTR 231 bp,推断其编码722个氨基酸,分子量79.4 kDa,根据序列比对将其蛋白命名为SpP5CS。对该蛋白质序列进行生物信息学分析表明:SpP5CS与冰叶日中花、海蓬子和葡萄等双子叶植物相似性较高,而与小麦、狗尾草和水稻等单子叶植物相似性较低。荧光定量PCR分析表明,该基因在海马齿的叶中表达量最高,在茎中其次;海马齿SpP5CS基因在各部分中的表达量随着盐胁迫的时间延长在叶中变化最为明显:在400和600 mmol·L-1 NaCl胁迫9 h表达量最高,在800 mmol·L-1NaCl胁迫12 h最高,其表达均表现先升高后降低的趋势。P5CS基因是植物体内合成脯氨酸的关键酶基因,SpP5CS基因的克隆将为作物抗逆分子育种和进一步的功能分析打下基础。
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巴斯德芽菌(Pasteuria spp.)基因组研究概况
《基因组学与应用生物学 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：巴斯德芽菌(Pasteuria spp.)为一类产内生芽胞、低G+C含量的革兰氏阳性菌。迄今为止,除了专性寄生水蚤的分支巴斯德芽菌外,已发现的巴斯德芽菌多为植物病原线虫的专性寄生菌,因此巴斯德芽菌作为最具潜力的植物线虫生防因子受到越来越多的重视。为了研究巴斯德芽菌的专性寄生机制及其遗传进化规律,各国科研人员相继开展了基因组学研究。本综述重点介绍分支巴斯德芽菌、穿刺巴斯德芽菌和P.nishizawae的基因组学研究进展。
关键词： 巴斯德芽菌(Pasteuria spp.) 基因组学 概况
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一株新型Bt菌株的鉴定及其抗椰子茎泻血病菌和杀小菜蛾活性
《热带作物学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：从海南采集的土样中分离鉴定获得1株可抑制椰子茎泻血病菌和杀小菜蛾幼虫的苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis,简称Bt)WENCHANG-BT20;经cry基因的鉴定明确了该菌株含有cry1Aa、cry1La、cry1Ai、cry1Ac、cry1Be、cry1Ka、cry1Ia、cry2Ab基因。生物学检测结果表明,该菌株晶体蛋白对小菜蛾幼虫的LC50为0.088μg/m L(95%置信区间为0.046~0.127μg/m L);该菌株对椰子茎泻血病菌菌丝生长有一定的抑制作用,平板对峙培养法培养5 d后,抑菌圈直径为22 mm。
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柱花草种间亲缘关系SSR分析
《草业科学 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：为研究柱花草(Stylosanthes spp.)种间的亲缘关系,本研究利用23个SSR标记对柱花草属14个种的33份材料的遗传关系进行了研究。结果表明,23个SSR标记在不同柱花草种间均具有多态性,共检测到等位基因138个,每个标记可检测到4~10个等位基因,平均6个;每个标记的多态性信息含量在0.501~0.830,平均为0.700。聚类分析和主成分分析结果表明,33份供试柱花草种质可分为5类,根据包含的基因组类型分别命名为AB类、AC类、J类、DE类、G类。毛叶柱花草(S.subsericea)和有钩柱花草(S.hamata)(I)的亲缘关系最近,有钩柱花草(I)与头状柱花草(S.capitata)的遗传关系较远。
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高粱SSR和EST-SSR标记在割手密中的通用性分析
《中国农学通报 》 2015 CSCD
摘要：目前,割手密中开发的分子标记有限,为增加其分子标记数量,本研究对高粱分子标记在割手密中的通用性进行分析。选用高粱的29对基因组SSR标记和20对EST-SSR标记在割手密种质GSM39中进行筛选,以评价其通用性。进一步利用14份割手密材料评价标记的多态性和遗传多样性。结果显示:70%的EST-SSR引物在割手密中得到成功扩增,可用的EST-SSR引物中多态性比率占50%。SSR引物在割手密中的通用性比率只有34.5%,但多态性比率为70%。14对多态性引物在14份割手密中共检测到33个等位基因,平均观测等位基因数为2.4286,平均有效等位基因数为1.7,平均观测表观杂合度为0.544,平均期望杂合度为0.3858,Nei’s基因多样性指数平均值为0.3716。结果表明,EST-SSR引物的通用性高于SSR引物,但SSR引物的多态性更高。这对割手密遗传多样性研究和比较基因组学研究具有重要意义。
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胶孢炭疽菌致病性减弱突变菌株H800T-DNA插入位点侧翼基因的克隆
《热带作物学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：对农杆菌介导转化引起的致病性减弱突变菌株H800的菌落形态、孢子形态、菌丝体生长速率、孢子萌发率和致病力等生物学特性进行研究,并利用TAIL-PCR方法克隆T-DNA插入位点基因,结合生物信息学分析该基因功能与H800表型变化及致病性减弱的关系。结果表明,突变菌株H800的致病力低于野生型菌株CH008;生长速率为0.83 cm/d,亦显著低于CH008的1.13 cm/d;产孢量和分生孢子大小与CH008无明显差异;孢子萌发率为2.58%,显著低于野生型的95.98%;序列分析显示,T-DNA已插入St Cg800基因的启动子区域,基因结构分析表明,St Cg800基因编码区全长774 bp,无内含子,可编码257个氨基酸多肽的St Cg800蛋白。该蛋白是不稳定的水溶性蛋白,亚细胞定位于细胞质,且无信号肽,推测为生长因子类的酶,但功能尚未知。
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