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转录组研究新技术:RNA-Seq及其应用

遗传 2011 北大核心 CSCD

摘要:转录组是特定组织或细胞在某一发育阶段或功能状态下转录出来的所有RNA的集合。转录组研究能够从整体水平研究基因功能以及基因结构,揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机理。RNA-Seq作为一种新的高效、快捷的转录组研究手段正在改变着人们对转录组的认识。RNA-Seq利用高通量测序技术对组织或细胞中所有RNA反转录而成的cDNA文库进行测序,通过统计相关读段(reads)数计算出不同RNA的表达量,发现新的转录本;如果有基因组参考序列,可以把转录本映射回基因组,确定转录本位置、剪切情况等更为全面的遗传信息,已广泛应用于生物学研究、医学研究、临床研究和药物研发等。文章主要介绍了RNA-Seq原理、技术特点及其应用,并就RNA-Seq技术面临的挑战和未来发展前景进行了讨论,为今后该技术的研究与应用提供参考。

关键词: RNA-Seq 转录组 新一代测序技术

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KN03、K2S04及其混盐胁迫对辣椒幼苗生理生化特性的影响

华北农学报 2011 北大核心 CSCD

摘要:为探讨日光温室土壤主要盐分对作物水分吸收、保护酶、渗透调节物质以及质膜透性的影响,以辣椒品种亮剑为研究试材,比较研究了50,100,150,200mmol/L的KNO3,K2SO4及其混盐处理对辣椒幼苗茎叶和根系含水量、叶片超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)和过氧化氢酶(CAT)活性、脯氨酸(Pro)和可溶性糖渗透调节物含量以及丙二醛(MDA)和渗透电解率质膜透性的影响.结果表明:随着盐处理浓度的增加,辣椒幼苗茎叶和根系水分含量相对于CK呈现出先升后降的趋势,200mmol/L处理含水量为最低;叶片SOD活性表现为先降后升的趋势,而POD和CAT呈现出降低一升高一降低的趋势;Pro、可溶性糖、MDA含量以及电解渗透率表现为逐渐升高的趋势.综合各项测定指标,K2SO4处理对辣椒幼苗生理生化特性影响程度明显大于混盐和KNO3.

关键词: 次生盐渍化 辣椒 生理生化特性 Secondary salinization Pepper Physiological and biochemical characteristics

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内蒙古东部井灌区不同密度与施肥水平对大麦蒙啤麦1号产量及蛋A质含量效应研究

大麦与谷类科学 2011

摘要:通过4因素4水平的正交试验,明确了大麦蒙啤麦1号在太仆寺旗的施肥水平与密度的最佳方案.结果表明:在施纯氮3.7 kg/667 m2,纯磷9.0 kg/667 m2,纯钾6.7 kg∥667 m2,密度25万彬667 m2时,可获得最高理论产量540.2 kg/667 m2,籽粒蛋白质含量达9.5%.

关键词: 蒙啤麦1号 密度 施肥水平

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枯草芽孢杆菌型微生态制剂在奶牛日粮中应用效果试验

饲料工业 2011 北大核心

摘要:试验基于研究芽孢杆菌型微生态制剂在奶牛日粮中的应用效果设计。试验选取市售枯草芽孢杆菌型微生态制剂,添加于近干乳期奶牛日粮中,进行效果求证和比较。结果显示,奶牛日粮中添加微生态制剂有助于提高奶牛日平均产奶量,有提高乳品质的趋势。

关键词: 芽孢杆菌 微生态制剂 奶牛

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肉羊浓缩料中添加黄腐酸和苦豆籽渣的青肥效果

饲料工业 2011 北大核心

摘要:30只11月龄平均体重40 kg的德美杂交肉羊按体重、性别平均分成3组,每组10只.分别喂给含有苦豆籽渣17.56%、黄腐酸0.4%和2%的浓缩料配制成的两种肉羊日粮与不合有此两种原料的第3种日粮(对照日粮),3组日粮的DM、、ME、CP营养指标基本相同.经63 d的饲养试验,结果表明:在每日进食DM、ME、CP数量相同的情况下,日粮中含有4.39%苦豆籽渣及含有0.1%和0.5%黄腐酸可提高育肥羊日增重6.3%和14.56%.

关键词: 苦豆籽渣:黄腐酸 浓缩料 育肥羊 日增重

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河套灌区春小麦高产栽培水氮高效利用研究

干旱区资源与环境 2011 北大核心 CSCD

摘要:在内蒙古河套灌区解放闸灌域沙壕渠实验站,通过田间试验,对节水灌溉模式(拔节+抽穗2水)和常规充分灌溉模式(分蘖+拔节+抽穗+灌浆4水)下,不同施氮量对春小麦产量形成、水分利用和氮素利用等方面进行了研究。结果表明:2水与4水处理间小麦产量及其构成因素均无显著差异,而水分利用效率(WUE)比4水处理提高7.8%。在较低施氮量范围内,随着施氮量的增加,小麦产量、耗水量和WUE同步提高,当施氮量超过一定值后,产量和WUE开始下降。两种灌溉模式下,增施氮肥均能促进植株对氮素的吸收,但氮素利用效率明显降低。与4水处理相比,2水处理下小麦氮素利用效率显著提高。小麦的经济产量、水分利用效率及氮素农学利用效率与总施氮量均呈一元二次曲线关系,河套平原春小麦实现节水、省肥、高产相统一的适宜施氮量(纯N)为8~10 kg/667m2。

关键词: 水分利用效率(WUE) 氮素利用效率(NUE) 高产 春小麦 河套灌区

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阴山北麓保护性耕作油菜田间杂草控制试验

山西农业科学 2011

摘要:据调查,阴山北麓保护性耕作油菜田初期杂草密度增加,田间杂草发生时间提前,上下茬农田杂草重叠发生,多年生杂草为害加重。采用化学除草、机械除草、人工除草、农业轮作等单因素和多因素除草技术进行研究。结果表明,采用综合除草"深松+高特克+胺苯磺隆+龙拳"和"中耕+高特克+胺苯磺隆+龙拳"除草效果好,杂草株防除率和鲜质量防除率均达90%以上。

关键词: 保护性耕作 油菜田 杂草 控制试验 综合除草技术

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MC4R基因研究进展

中国草食动物 2011

摘要:黑素皮质素受体-4(melanocortin-4 receptor,MC4R)是下丘脑腹内侧核分泌的一类肽类物质,为黑素皮质素受体家族5个亚型(MC1-5R)之一。在哺乳动物中,MC4R具有介导瘦蛋白(leptin)的功能,是一个调节能量平衡与能量动态平衡的重要信号分子,可与其内源性配体黑素皮质素激素(melanocortin,MC)或刺鼠色蛋白(agouti protein,agouti蛋白)和agouti相关蛋白(agouti related protein,AGRP)相结合,从而在控制食欲和体重稳态中起关键作用。因此,MC4R在人类肥胖研究中作为重要的调节因子倍受关注。最近有研究表明:MC4R的1232位点的G→A的突变与绵羊背膘厚度间存在关联,AG和AA型较GG型具有较高的背膘厚度。

关键词: 黑素皮质素受体-4(MC4R) MC4R基因多态性 肥胖调节因子 背膘厚度

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蒙古马突触融合蛋白17(STX17)基因多态性及在不同毛色皮肤组织中的表达分析

畜牧兽医学报 2011 北大核心 CSCD

摘要:为研究突触融合蛋白17(STX17)基因与蒙古马毛色之间的相关性及其作用机制。本研究利用半巢式PCR技术及实时荧光定量PCR技术对蒙古马STX17基因第6内含子的多态性以及不同毛色蒙古马皮肤组织中STX17基因的相对表达量进行了检测。巢式PCR结果显示:STX17基因在青毛蒙古马第6内含子处存在4.6kb的重复片段,在其它毛色中不存在该重复片段;荧光定量PCR结果显示:STX17基因在蒙古马青毛皮肤组织中表达量最高,在骝毛皮肤组织中的表达量最低。结果证明蒙古马STX17基因与其青毛表型具有典型的相关性。

关键词: 蒙古马 STX17基因 多态性 基因表达量

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添加菊科植物黄花蒿乙醇提取物对奶牛乳腺上皮细胞脂肪酸组成的影响

畜牧与饲料科学 2011

摘要:试验采用体外乳腺组织培养,乳腺组织来源于1头健康的泌乳奶牛,黄花蒿提取物冻干粉的添加剂量分别为0、2.5、5和10mg/L4个组。结果表明,3个黄花蒿提取物处理组均增加了乳腺上皮细胞中CLA的含量,同时增加了SCD酶去饱和酶指数,说明添加黄花蒿乙醇提取物增加乳腺上皮细胞中CLA的含量是因为增加了SCD酶的活性。

关键词: 黄花蒿乙醇提取物 奶牛乳腺组织培养 CLA

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