科研产出
基于SNP标记的小麦品种遗传相似度及其检测准确度分析
《作物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要:遗传相似度检测的准确度估计是对SNP标记法在农作物品种检测体系中应用的必要补充和完善。本研究基于2021年小麦品种SNP标记法跨实验室协同验证实验数据,分析了该方法的检测准确度及在品种间的遗传相似度。分析结果表明:(1) 10个实验室对55组小麦品种组合的标记位点相似度检测的总体准确度约为98%。(2) GGE双标图的品种遗传关系功能图显示,7组小麦品种的组内遗传相似度在95%以上,其余组合的遗传相似度较低。(3)依据GGE双标图的“正确度-精确度”功能图和“准确度排序”功能图,发现洛旱7号/洛旱11等品种组合的相似度检测准确度较高,晋麦47/临抗11的检测准确度一般,而济麦22/婴泊700的检测准确度较差。(4)10个实验室的检测准确度存在显著差异,其中2个实验室检测的正确度、精确度和准确度表现显著差于其余实验室。(5)各实验室检测正确度的容许误差分布于1.3%~1.9%之间,平均为1.5%;准确度的容许误差分布于1.5%~2.0%之间,平均为1.7%。其中,Lab2和Lab3的检测正确度和准确度的容许误差显著差于其余实验室。本研究构建了SNP标记法对品种相似性检测的准确度统计模型,分析了品种组合和实验室的检测准确度及其容许误差,采用GGE双标图方法对检测正确度、精确度和准确度进行可视化分析,验证了各实验室对品种位点相似性检测的准确度和可靠性,为SNP标记法在农作物品种遗传相似性检测中的准确度评价提供了理论支持和应用范例。
关键词: 小麦(Triticum aestivum L.) GGE双标图 SNP标记 遗传相似度 位点相似度 准确度


藜麦CqANS基因的克隆及表达分析
《贵州农业科学 》 2024 北大核心
摘要:[目的]通过藜麦ANS基因生物信息学分析,研究其蛋白相关特性,为进一步阐明藜麦CqANS基因发挥作用的分子机制提供基础.[方法]通过PCR反应克隆藜麦ANS基因(CqANS)的cDNA全长序列,进而对CqANS编码的蛋白质序列及特征进行预测分析,同时利用实时定量PCR对该基因在不同胁迫处理下的表达进行分析.[结果]藜麦ANS基因包含 2个外显子和 1个内含子,其编码的蛋白质编码 359个氨基酸残基;藜麦CqANS蛋白为亲水性蛋白,不存在信号肽,蛋白质定位于细胞质;其属于PLN03178超家族,具有典型的Fe2+-依赖的双加氧酶家族(2OG-FeⅡ_Oxy)的保守结构域.启动子分析显示在CqANS上游启动子区域存在多种响应非生物胁迫的顺式作用元件.低温胁迫诱导CqANS的表达,而外源ABA处理及干旱处理则抑制CqANS的表达.CqANS与包括AUR62014624-RA在内的多个蛋白存在互作关系.[结论]藜麦ANS基因(CqANS)具有ANS基因家族特征,可能与其他植物的ANS基因存在相似的生物学功能.


水稻氮素利用相关基因遗传研究进展
《江苏农业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要:水稻氮素利用效率的高低直接影响水稻产量以及生态环境.在水稻氮素利用相关基因的研究中,研究人员通过连锁作图和关联作图等方法克隆基因,并解析水稻的氮素利用机理,为水稻氮素高效利用育种提供了基因资源.本文从水稻氮素利用QTL定位及基因克隆,基于全基因组关联分析的水稻氮素利用相关基因克隆,利用突变体克隆水稻氮素利用相关基因,利用反向遗传学克隆水稻氮素利用相关基因等方面总结了近年水稻氮素利用相关基因的研究进展.同时对该领域的未来研究进行了展望.本文为水稻氮素高效利用基因的研究和氮素高效利用育种提供了参考.


不同品种紫甘薯全粉挤压膨化圈品质特性研究
《中国粮油学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要:本实验以6种紫甘薯全粉为原料,采用双螺杆挤压膨化机制备紫甘薯膨化圈,测定基本组分、膨化、糊化及质构等指标,评价挤压膨化对紫甘薯膨化圈品质的影响,以期预测不同品种紫甘薯全粉原料挤压膨化加工适用性.结果表明:挤压膨化后淀粉含量和花色苷含量均显著降低,可溶性糖含量显著增加;与紫甘薯全粉相比,膨化圈的水溶性指数和吸水性指数均显著增加,其中徐紫薯8号、徐紫薯13号和徐薯D6-24增幅倍数最高;不同品种紫甘薯膨化圈的径向膨化率差异显著,徐紫薯8号、徐紫薯13号、徐薯D6-24具有更高的径向膨化率;徐紫薯13号和徐薯D6-24的糊化度、冷糊稳定性和抗老化性较好,表明其具有更高的熟化度和更优质的口感;徐紫薯8号、徐紫薯13号、徐薯D6-24具有较小的硬度和咀嚼度,黏度适中.综合评价,挤压膨化能明显改善紫甘薯的加工性能和食用特性,其中徐紫薯13号、徐紫薯8号、徐薯D6-24膨化圈品质最佳.


麝香草酚控制核盘菌侵染不结球白菜效应研究
《河南工业大学学报(自然科学版) 》 2024 北大核心
摘要:核盘菌可侵染多种蔬菜,造成蔬菜采后品质下降,筛选高效安全的天然保鲜剂是控制核盘菌侵染的有效手段。通过离体和活体接种试验,研究了植物源天然化合物麝香草酚对核盘菌侵染青菜的控制效应。结果表明:20、40、60μg/mL麝香草酚处理后的菌丝鲜重分别比对照组显著下降了33.8%、53.7%、88.1%;菌丝干重分别比对照组下降了24.5%、53.7%、82.9%;麝香草酚处理导致核盘菌菌丝畸形、皱缩、细胞死亡,可能与菌丝细胞膜损伤有关,表现为相对电导率和丙二醛含量上升;麝香草酚还可诱导菌丝细胞甘油含量显著上升,发生渗透胁迫;50μg/mL麝香草酚处理青菜可显著抑制核盘菌在叶片上的侵染;在接种核盘菌的青菜叶片中,麝香草酚诱导特异型抗性基因BrMPK3和BrMPK4的表达量上调,并显著提升青菜品质(包括叶绿素、蛋白质、可溶性糖、维生素C含量提升)。麝香草酚可有效控制核盘菌对青菜的侵染,表现为抑菌效应和诱导寄主抗性效应。


优质高产小麦新品种富麦999的选育及主要特征特性
《大麦与谷类科学 》 2024
摘要:富麦999是江苏省农业科学院宿迁农科所、安徽省创富种业有限公司和安徽夏兴种业有限公司以济麦22为母本、(太空6号/山农16)F,为父本杂交,利用系谱法选育而成的半冬性优质高产小麦新品种.区域试验结果显示,该品种全生育期222.7 d,株高81.9 cm,有效穗数649.5万个/hm2,成穗率40.2%,穗粒数31.9粒/穗,千粒质量46.9 g;中感赤霉病、感纹枯病、中感-中抗白粉病;2023年通过安徽省农作物品种审定委员会审定(审定编号:皖审麦2023L022),适宜在安徽省淮北及沿淮地区种植.


大豆株高全基因组关联分析
《中国油料作物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要:以包含264份种质材料的大豆自然群体为研究对象,调查该群体2019年和2020年的大豆株高性状,并进行全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS),解析大豆株高遗传机制。研究发现大豆群体株高变异丰富,呈连续分布状态,广义遗传力为67.38%,同时检测到91个SNP与大豆株高显著关联,分别位于第3、4、6和19号染色体上。其中位于19号上的显著关联信号是一个控制大豆株高的主效位点,可以在2年环境中检测到,表型变异解释率最高达12.19%。对该位点内的候选基因进行筛选获得5个调控大豆株高候选基因,其中GmDt1可能是这个位点的效应基因。除此以外,在3号和6号染色体上筛选得到3个调控大豆株高的候选基因。本研究结果为大豆株高遗传改良提供了新的基因资源和参考依据。


氨基酸的生理作用及含氨基酸水溶肥料在果树上的应用策略
《江苏农业科学 》 2024 北大核心
摘要:氨基酸不仅是作物的养分来源,在植物生长发育过程中也发挥重要的信号作用,参与植株生长发育、果实品质形成、逆境抵御等各种生理活动.含氨基酸水溶肥料是以氨基酸(游离态)为主要成分,按照行业标准指标制备的新型肥料,具备溶解性好、见效快、利用率高等特点,近年来在园艺作物生产中得到广泛应用.在当前"药肥减量"政策和低碳农业背景下,新型肥料成为我国肥料行业转型发展的重要突破口,开发绿色、高效的新型肥料成为业内共识;进一步开展氨基酸生理功能研究与新型肥料创制,完善产品施用技术具有重要意义.本文综述氨基酸在影响植物生长和品质形成、增强植株非生物胁迫抵御能力、调控土壤微生物群落、激活植物系统免疫等方面的研究进展,阐述氨基酸制备工艺及含氨基酸水溶肥料产品的现状,并提出含氨基酸水溶肥料产品在果树上的应用策略.


N端携带HBGAs受体结合表位的兔出血症病毒嵌合VP60蛋白的表达及其免疫原性
《江苏农业科学 》 2024 北大核心
摘要:将HBGAs受体结合表位插入兔出血症病毒(RHDV)衣壳蛋白VP60的N端,分析嵌合VP60蛋白的表达及病毒样颗粒(VLPs)形成情况,并研究N端HBGAs受体结合表位的插入对嵌合VP60蛋白免疫原性的影响。通过VP60蛋白N端起始位点HBGAs受体结合表位的插入,获得表位插入的VP60基因。利用Bac-to-Bac系统构建杆状病毒重组质粒,命名为Bacmid-VP60-CR,转染Sf9昆虫细胞后,得到重组杆状病毒rBac-VP60-CR,经HA、IFA和Western Blot鉴定,结果显示,重组蛋白VP60-CR在Sf 9昆虫细胞中得到高效表达,电镜观察显示其可形成与VP60类似的VLPs结构。将重组蛋白免疫2月龄RHDV血清阴性的新西兰兔,200μg/只,免疫后每周采血检测HBGAs表位抗体水平,同时在免疫后14 d,以RHDV WF株攻毒观察VP60-CR重组蛋白的免疫保护效果。结果显示,与VP60对照相比,VP60-CR蛋白可产生更高水平的针对HBGAs表位的抗体水平,且VP60-CR免疫兔可完全抵抗RHDV强毒的攻击。本研究构建了一种N端插入HBGAs受体结合表位的嵌合VP60蛋白,为研究高免疫原性兔出血症基因工程疫苗抗原奠定了基础。
关键词: 兔出血症病毒 VP60蛋白 HBGAs 病毒样颗粒 免疫原性

